Estandarización y aplicación de la metodología del ADN ambiental para el estudio de la biodiversidad acuática del delta del Río Paraná

ERMINI, JACKELINE; CARABAJAL, SOFÍA; GALETH, KERLY; DEL PAZO, FELIPE; SIMÓ, IGNACIO; MASCALI, FLORENCIA; MARTIN, ANA PAULA; POSNER, VICTORIA; SCIARA, ANDRÉS A.; ROMERO MARANO, EMANUEL; BORDÍN, FEDERICO; MITCHELL, CLARA; TAPIA, ELIZABETH; BULACIO, PILAR; RUBIOLO, JUAN; VILLANOVA, G. VANINA

Chascomús

Simposio; 7mo Simposio Argentino de Ictiología; 2022

ESTANDARIZACIÓN Y APLICACIÓN DE LA METODOLOGÍA DEL ADN AMBIENTAL PARA ELESTUDIO DE LA BIODIVERSIDAD ACUÁTICA DEL DELTA DEL RÍO PARANÁErmini, J.; Carabajal, S.; Galeth, K.; Del Pazo, F.; Simó, I.; Mascali, F., Martin, A.; Posner V.;Sciara A.; Romero Marano E.; Bordín F.; Mitchell C.; Tapia E.; Bulacio P.; Rubiolo J.; Villanova,G.Laboratorio Mixto de Biotecnología Acuática del Centro Científico, Tecnológico y Educativo Acuario del ríoParaná (LMBA), FBioyF-UNR-SCTeI. Rosario, Argentina. Email: jackiermini@gmail.comEl Delta del Río Paraná constituye uno de los sistemas de humedales más importantes de Sudamérica. Los incendios intencionales, la bajante del río y los procesos de “pampeanización” afectan la integridad del ecosistema.Con el objetivo de estudiar el impacto antrópico sobre la biodiversidad acuática y la fauna ictícola del Delta, este trabajo propone la estandarización y aplicación de la metodología del ADN ambiental utilizando metabarcoding de los genes COI, 18s rRNA y 16s rRNA, y secuenciación masiva de tercera generación a través de la tecnología de Oxford Nanopore, para su estudio. En una primera etapa se avanzó en la estandarización de la tecnología utilizando mocks de ADN bacteriano, de levaduras y de peces, y agua proveniente de tanques de cultivo de peces, de composición conocida. Se realizó la puesta a punto de la extracción de ADN y las condiciones de PCR. Luego se realizaron las PCRs, cada muestra se identificó a través de un código de barras y se secuenciaron conjuntamente utilizando MinION (Nanopore). Las secuencias obtenidas se procesaron y se evaluaron diferentes herramientas bioinformáticas. Se establecieron las bases de datos a utilizar para la asignación de los diferentes grupos taxonómicos. Finalmente se identificaron los grupos presentes en los diferentes mocks y en el agua del tanque de cultivo. Actualmente estamos trabajando en la aplicación de la metodología estandarizada para evaluar la diversidad de peces, protistas, hongos y bacterias en cuatro lagunas internas de la Isla de Los Mástiles (32°50'14"S 60°40'31"W), dos de ellas afectadas por los incendios del año 2020 y dos no afectadas.