Estandarización y aplicación de la metodología de ADN ambiental para el estudio de la diversidad acuática del delta del río Paraná

ERMINI, J.; CARABAJAL, S.; DEL PAZO, F.; MASCALI, F.; MARTIN, A.P.; POSNER, V.; SCIARA, A.A.; RUBIOLO, J.A.; VILLANOVA, G.V.

Chascomus

Simposio; VII Simposio Argentino de Ictiología; 2022

INTECH

El Delta del Río Paraná constituye uno de los sistemas de humedales más importantes deSudamérica. Los incendios intencionales, la bajante del río y los procesos de“pampeanización” afectan la integridad del ecosistema.Con el objetivo de estudiar el impacto antrópico sobre la biodiversidad acuática y la faunaictícola del Delta, este trabajo propone la estandarización y aplicación de la metodologíadel ADN ambiental utilizando metabarcoding de los genes COI, 18s rRNA y 16s rRNA, ysecuenciación masiva de tercera generación a través de la tecnología de Oxford Nanopore,para su estudio.En una primera etapa se avanzó en la estandarización de la tecnología utilizando mocks deADN bacteriano, de levaduras y de peces, y agua proveniente de tanques de cultivo depeces, de composición conocida. Se realizó la puesta a punto de la extracción de ADN y lascondiciones de PCR. Luego se realizaron las PCRs, cada muestra se identificó a través de uncódigo de barras y se secuenciaron conjuntamente utilizando MinION (Nanopore). Lassecuencias obtenidas se procesaron y se evaluaron diferentes herramientasbioinformáticas. Se establecieron las bases de datos a utilizar para la asignación de losdiferentes grupos taxonómicos. Finalmente se identificaron los grupos presentes en losdiferentes mocks y en el agua del tanque de cultivo.Actualmente estamos trabajando en la aplicación de la metodología estandarizada paraevaluar la diversidad de peces, protistas, hongos y bacterias en cuatro lagunas internas dela Isla de Los Mástiles (32°50'14"S 60°40'31"W), dos de ellas afectadas por los incendios delaño 2020 y dos no afectadas