LA CARACTERIZACIÓN GENÓMICA ACTUALIZADA Y EL ANÁLISIS DE EVOLUCIÓN MOLECULAR DE LAS CEPAS BF RECOMBINANTES DE HIV-1 ENTRE HOMBRES QUE TIENEN SEXO CON HOMBRES (HSH) DE ARGENTINA REVELA UN ESCENARIO COMPLEJO

CEVALLOS C, JONES L , PANDO M DE LOS A , AVILA M , QUARLERI J

BUENOS AIRES

Congreso; XII CONGRESO ARGENTINO DE VIROLOGIA; 2017

SOCIEDAD ARGENTINA DE VIROLOGIA

El fenómeno de recombinación es uno de los mecanismos que colaboracon la diversidad del HIV-1 y favorece la generación de formasrecombinantes circulantes o únicas (CRFS/URFs), las cuales puedenpresentar estructuras complejas. En Argentina la epidemia de HIV-1 estáprincipalmente representada por el subtipo B y por cepas recombinantesentre los subtipos B y F. En la población de hombres que tienen sexo conhombres (HSH) -uno de los grupos de mayor prevalencia de infeccióndichacaracterización genómica fue realizada principalmente porfilogenia y, desde entonces, no se ha aportado ninguna otra evidenciasobre la variabilidad genética del HIV-1 asociada con los recombinantesBF entre HSH.En este trabajo, se analizó un total de 337 secuencias de HIV-1 (25secuencias casi completas ?NFL- y 312 secuencias parciales del gen pol)provenientes de HSH de Argentina y obtenidas durante los años 2000-2009. Las secuencias propias se alinearon con subtipos de referencia yse analizaron filogenéticamente mediante Máxima Verosimilitud. Lahistoria evolutiva de las recombinantes BF y de secuencias de subtipo Bfue estimada mediante inferencia Bayesiana usando BEAST1.7.4. El perfilde recombinación fue ensayado mediante los siguientes métodos:jumping profile Hidden Markov Model (jpHMM), recombination analysisusing cost optimization (RECCO), and recombination detection program(RDP4), incluyendo Bootscaning (Simplot) para las secuencias NFL. La filogenia de las secuencias de pol, mostró que 81/312 agruparondentro del clado BF. De ellas, 46 estuvieron cercanamente relacionadasa CRF12_BF, 14 a otras CRFs_BF (17, 28, 29, 39, 42, 44, 47) y 21segregaron independientemente de las CRFs_BF de referencias definidascomo URFs_BF. Los diferentes métodos implementados detectaronpatrones de recombinación diversos. Dos de ellos, denominados A y Bfueron predominantes y exhibieron un breakpoint en diferentesposiciones (3000±25 y 2461±22, respectivamente), ambos presentes enCRF12_BF. Además el breakpoint en el patrón B también está presenteen CRF38_BF. El análisis filogenético y de patrones de recombinaciónrealizado sobre secuencias NFL, permitió definir nuevos mosaicos BF. Losanálisis Bayesianos realizados sobre los fragmentos B y F provenientesde las secuencias recombinantes estimaron los tiempos de coalescenciade los ancestros (tMRCAs) en ~1986 y ~1991 respectivamente, mientrasque para el subtipo B el tMRCA fue estimado en ~1979.Este estudio revela, que en HSH las recombinantes BF de HIV-1caracterizadas, presentan estructuras más complejas y heterogéneasque las descriptas hasta el momento, exhibiendo patrones derecombinación diversos que incluyen URFs_BF no reportadas, quecomparten breakpoints con CRF12_BF. El análisis filodinámico evidenciaque, el fenómeno de recombinación es dinámico y persistente entre HSHen Argentina, indicando la importancia de esta población en la dinámicade la epidemia de HIV-1 en Argentina.