DEEP-SEQUENCING EN EL MONITOREO DE LA RESISTENCIA A ANTIVIRALES POR HBV Y HCV

QUARLERI JORGE

BUENOS AIRES

Congreso; XII CONGRESO ARGENTINO DE VIROLOGIA; 2017

SOCIEDAD ARGENTINA DE VIROLOGIA

La detección de resistencia a fármacos con acción antiviral puedehacerse empleando métodos genotípicos y métodos fenotípicos. Ante laaccesibilidad, centraremos la atención en los primeros, basados en labúsqueda de mutaciones de resistencia en los genes codificantes de losblancos de acción de las drogas en uso. Los métodos más empleados sonaquellos que se basan en la secuenciación directa de ácidos nucleicos, oen técnicas de hibridación. La secuenciación en su modalidad ?directa?tiene como principal desventaja su falta de sensibilidad en la detecciónde las poblaciones resistentes cuando éstas representan menos del 20%de la población viral (minoritarias), limitando su utilidad para detectarresistencias precozmente. Metodológicamente, esta limitación puedesuperarse con las alternativas de secuenciación profunda o ?deepsequencing?, pero su utilidad en términos clínicos es aún motivo decontroversias.Los virus de las hepatitis B (HBV) y C (HCV) son responsables de unaelevada morbimortalidad de distribución mundial. Las consecuenciasclínicas de las infecciones por estos virus van a depender de factoresrelacionados con el hospedador y con el agente viral. Entre estos últimos,son relevantes aquellos que se relacionan con la respuesta altratamiento antiviral (aparición de mutantes de resistencia y la infecciónasociada a genotipos específicos del virus). En el caso del HBV, esrelevante la presencia y acumulación de mutaciones responsables de laresistencia a los antivirales aprobados para el tratamiento de lainfección. Se han desarrollado técnicas para la detección de dichasmutaciones, así como algoritmos para predecir la respuesta altratamiento.En los pacientes infectados por el HCV, sin embargo, la respuesta altratamiento con drogas de acción directa (DAA) es aún controversial. Apesar de la ausencia de formas genómicas capaces de insertarse en elgenoma celular (a diferencia de HBV), dada la alta producción de virionesde HCV y la elevada tasa de error de la polimerasa (10-4sustituciones porbase por año), la posibilidad que existan polimorfismos de resistenciabasal y/o que se desarrollen en muy corto plazo luego de la exposición aDAA es alta.En el curso natural del ciclo de replicación de HCV predomina la variantesalvaje o wild type, sin embargo pueden encontrarse variantes conmutaciones que eventualmente podrían conferir resistencia a las DAA,es decir puede verificarse su existencia en pacientes naïve detratamiento y luego ser rápidamente seleccionadas en monoterapias conDAA. Por lo tanto, estas variantes resistentes se consideran comopreexistentes en el curso natural de la infección y en una primerainstancia, fueron sugeridas por modelos teóricos que tomaron enconsideración las características replicativas de HCV. Luego con eladvenimiento de las técnicas de secuenciación profunda fue posiblecorroborar las predicciones de estos modelos de forma empírica,detectándose variantes minoritarias con una sensibilidad menor al 1%.