Identificación de diferentes mosaicos genéticos BF en la caracterización y evolución molecular del HIV-1 en HSH de Argentina

CEVALLOS, C; AVILA MM, PANDO MA, MARONE R, JONES L, QUARLERI J

Buenos Aires

Otro; Reunión Citntífica Anual de la Sociedad Argentina de Virología; 2016

AAM-SAV

En Argentina, los estudios pioneros de caracterización molecular del HIV-1 exhibieron predominantemente la presencia de subtipo B y formas recombinantes BF1. Estos estudios dejaron ver las prevalencias diferenciales entre ambos, concluyendo en un panorama dicotómico según las vías de transmisión. Así en hombres que tienen sexo con hombres (HSH), se reportó amplio predominio del subtipo B.Objetivos: Establecer relaciones filogenéticas entre aislamientos de HIV-1 en HSH, caracterizar el mosaicismo genético y analizar la ancestralidad de las formas recombinantes BF1 caracterizadas.Métodos: Se analizaron 336 secuencias nucleotídicas de HSH entre los años 2000-2009, (311 secuencias de , y 25 casi completas ?NFL-). Se alinearon (MAFFT) con secuencias de referencia (Los Alamos Database) y se realizó la filogenia por máxima verosimilitud (PhyML). La posición de los se estableció por diferentes estrategias : (jpHMM), (RECCO), (RDP4) y, sólo para NFL, también se utilizó (SimPlot). Se realizó un análisis de concordancia (índice Kappa de Fleiss; SPSS v.20). Se realizó un análisis de coalescencia para las secuencias recombinantes (BEAST 1.7.4). Las relaciones filogenéticas entre las 311 secuencias de muestran a 86 agrupando en el clado BF1, 223 en el clado B, y 2 con el subtipo C. Tras el análisis de posición de los , se definieron dos mosaicos genéticos denominados A (n=30) y B (n=11), que podrían relacionarse con CRF12 y CRF38_BF1, respectivamente. Las 45 restantes mostraron inconsistencias según el método de análisis empleado. Resultados: La filogenia de las 25 NFL mostró 4 agrupando en el clado BF1, y 21 integrando el clado B. Al analizar la posición de los , se caracterizó consistentemente usando los diferentes métodos, la presencia de formas recombinantes BF1 con mosaicos semejantes a CRF12 (2), y diferentes (2), incluyendo una triple recombinante BCF1. Luego de analizar las 21 secuencias integradas al clado B, 3 exhibieron la presencia de fragmentos F1, de limitada longitud en algunos casos (