IBS   24490
INSTITUTO DE BIOLOGIA SUBTROPICAL
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO EN EL GENOMA BOVINO: QUÉ CONSEGUIMOS VER CON 50.000 SNPS?
Autor/es:
LITWINIUK, S.; CARIGNANO, H.; POLI, M.; MIRETTI, M.
Lugar:
Posadas
Reunión:
Jornada; IX Jornadas Científico Tecnológicas  de la FCEQyN, Universidad Nacional de Misiones, Argentina; 2015
Institución organizadora:
SeCyT, FCEQyN, UNaM
Resumen:
El uso de marcadores genéticos ha posibilitado detectar regiones del genoma asociadas ala expresión fenotípica de loci para caracteres cuantitativos (QTL). Las tecnologías degenotipificación actuales hacen posible la detección simultánea de >700.000 SNPs porindividuo. El estudio del desequilibrio de ligamiento (LD) permite detectar la incidencia dela recombinación y describir la genealogía de los bloques de segregación en porciones delgenoma que contienen genes de importancia económica. La estimación del LD es unaimportante herramienta considerada en los programas de ?Selección Genómica?. Elobjetivo de este trabajo fue evaluar los alcances de las estimaciones de LD a partir dedatos de genotipificación de mediana resolución (>50.000 SNPs) en bovinos. El LD medioy decaimiento del LD en función de la distancia física a lo largo de los cromosomas y enregiones específicas fueron estimados y graficados. También se estimaron valores decobertura ?área total bajo LD? y longitud media de los bloques de haplotipos. Finalmenteregiones genómicas con baja densidad de marcadores fueron analizadas en detalle a finde encontrar indicios de la naturaleza de tales deficiencias en las densidades de SNPs. Eneste estudio se ha caracterizado el desequilibrio de ligamiento y la estructura haplotípicade una población comercial de bovinos lecheros (Bos taurus) con datos degenotipificación generados para >900 individuos. Los resultados obtenidos sonrelavantes para el análisis de LD en forma global en el genoma. No obstante, el área decobertura es proporcionalmente muy baja al igual que el LD útil comparado con estudiosprevios. El LD contribuye a determinar más efectivamente el mapeo genético y físico, ypara la predicción más eficiente de características asociadas al aumento en la produccióny resistencia a enfermedades.