SECUENCIACIÓN Y ANÁLISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE YERBA MATE

LITWINIUK S.; ARGÜELLES C.; FAY J.; TALAVERA STEFANI L.; FERRERAS J.; MIRETTI M.

Buenos Aires

Jornada; Jornadas Argentinas de Genética 2021; 2021

Sociedad argentina de Genética

SECUENCIACIÓN Y ANÁLISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE YERBA MATEFay J.1, S. Litwiñiuk1, L. Talavera1, J. Ferreras1, C. Argüelles1, M. Miretti1. 1Grupo de Investigación en Genética Aplicada(GIGA)- FCEQyN, IBS, UNaM?CONICET, Posadas, Misiones, Argentina. jessy_gen@hotmail.comEl transcriptoma proporciona información directa sobre la expresión génica global en tiempo y espacioespecíficos. La yerba mate (YM) (Ilex paraguariensis A. St.-Hil 1822) representa el producto de la economíaregional más importante del noreste argentino, ubicándose entre las especies de interés industrial con altosniveles de antioxidantes. Sin embargo, son recientes los accesos a la biotecnología y estudios genéticos aplicadosa su producción. Nuestro objetivo fue generar un transcriptoma de referencia para YM como base para nuevasinvestigaciones, desarrollo de programas de mejoramiento y aplicaciones biotecnológicas de esta especie.Generamos un transcriptoma confiable basado en 15 bibliotecas de RNA-Seq de diferentes tejidos de YM. Seconsideraron muestras de hojas, saludables y enfermas (rulo de la YM) asociadas a una de las principales plagasdel cultivo Gyropsilla spegazziniana, colectadas de plantas adultas crecidas a campo; plántulas enteras de viverosy raíces de plántulas. Un total de 193.897 transcriptos fueron ensamblados y, más del 60% fueron asociados consecuencias de proteínas. Se identificaron 531 transcriptos asociados a síntesis de compuestos antioxidantes, yocho genes involucrados en pasos iniciales de la biosíntesis fueron validados experimentalmente. El análisis deperfiles de expresión reveló genes con expresión diferencial entre tejidos de YM, validándose experimentalmenteesta divergencia mediante q-PCR. El análisis comparativo entre hojas saludables y enfermas de una mismaplanta mostró genes de respuesta a estrés biótico regulados positivamente en hojas deformadas. Los transcriptosensamblados se encuentran disponibles en la base de datos pública NCBI, representando una referencia para losestudios genómicos de I. paraguariensis y estableciendo el contexto para investigar genes candidatos asociados asíntesis de compuestos de interés, respuesta a enfermedades, estrés abiótico e interacciones de microorganismosen la producción de YM.TÉCNICAS