INVESTIGADORES
LIRON Juan Pedro
congresos y reuniones científicas
Título:
GENOTIPIFICACIÓN Y ANÁLISIS DE MUESTRAS BOVINAS MEDIANTE LA TECNOLOGÍA AXIOM® DE MICROARRAYS DE HD EN ARGENTINA
Autor/es:
GIOVAMBATTISTA G.; LIRON J.P.; ROGBERG MUNOZ A.; FORNERIS NS.; POSIK DM.; VILLEGAS CASTAGNASSO EE; MORALES HF.; OLIVERA LH.; CANTET R.J.C; PERAL GARCIA P.
Lugar:
Bariloche
Reunión:
Congreso; XLIII Congreso Argentino de Genética y IV Reunión Regional SAG La Pampa-Patagonia; 2014
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genética
Resumen:
Durante los últimos años, la tecnología de microarrays
de SNPs ha sido ampliamente utilizada en bovinos para
estudiar la diversidad genética de las poblaciones, las
relaciones entre las razas, la evolución del genoma de esta
especie (desequilibrio de ligamiento, selección, etc.), la
determinación del grado de parentesco genómico entre
individuos, el origen de muestras e individuos (asignación
racial), así como, para mapear regiones/genes asociadas a
caracteres cuali y cuantitativos. Además, esta tecnología
ya está siendo aplicada rutinariamente en los procesos
de mejora genética en muchas razas bovinas. Durante el
presente año se ha instalado en el IGEVET una plataforma
GeneTitan® (Affymetrix, CA, USA), iniciándose
los estudios de tipificación de muestras de ADN
pertenecientes a las principales razas bovinas criadas en el
país mediante el array de alta densidad de SNPs Affymetrix
Axiom Genome-Wide BOS 1 Array (648.874 SNP). En la
presente disertación se presentan y discuten los resultados
obtenidos hasta el momento, los que permitieron las
estimaciones del call rate por muestra y por SNP, los
valores promedios y la distribución de locus polimórficos,
los valores de MAF y heterocigosidad, el equilibrio de
Hardy-Weinberg, y el tamaño promedio y distribución de
los bloques de ligamiento. Los resultados obtenidos son
comparados y discutidos con aquellos estimados a partir
del uso de los arrays Illumina High-Density Bovine BeadChip
Array (777.962 SNPs) y BovineSNP50 v2 DNA Analysis
BeadChip (54.609 SNPs).