Coding translational rates: the hidden genetic code

LUIS DIAMBRA

Buenos aires

Workshop; Biología Celular y Molecular del ARN; 2018

Instituto Leloir

La degeneración en el código genético implica que diferentes codones pueden codificar el mismo aminoácido. La preferencia de uso de codones sinónimos se ha observado en todos los reinos. Existe evidencia que sugiere que este sesgo tendría un papel importante en la tasa de elongación de proteínas. Sin embargo, en un estudio reciente, se ha mostrado que los pares de codones adyacentes (bicodones) tienen una preferencia de uso significativamente diferente para codificar proteínas de escasa abundancia o proteínas muy abundantes. Estas preferencias de uso no pueden ser explicadas por el sesgo de los codones individuales. El análisis estadístico de secuencias de codificantes de varios organismos ha revelado que las preferencias de uso de bicodones se comparten entre organismos relacionados. Por otro lado, analizamos mas de 30 SNP sinónimos de 22 enfermedades asociados a alteraciones en el programa de atenuación de tasa traduccional. Estas alteraciones afectan la conformación y la función de las proteínas. Observamos que el plegamiento incorrecto en las proteínas se explica mejor por un gran cambio en la propensión a la pausa debido a la variante de un bicodon sinónimo, que por la variación de preferencia de uso de codones sinónimos. Estos hallazgos sugieren que el uso de bicodones puede ser un marco más poderoso para comprender la tasa de elongación de la traducción, la eficacia del plegamiento de proteínas y para mejorar los protocolos para la expresión génica heteróloga.