SECUENCIACIÓN COMPLETA Y ANÁLISIS COMPARATIVO DE LOS GENOMAS CLOROPLASTICOS DE Solanum Tuberosum Y Solanum Phureja

BARREIRO LEANDRO; L. DIAMBRA; FEINGOLD SERGIO

Cuzco

Simposio; I Simposium Internacional de Recursos Genéticos de la Papa; 2010

Asociación Latinoamericana de la Papa

La genómica de organelas se ha convertido en un campo de estudio muy importante con aplicaciones en modelos moleculares, filogenia, taxonomía, genética de poblaciones y biodiversidad. En general, involucran la determinación y análisis comparativo de secuencias genómicas completas de cloroplastos y mitocondrias, tanto de especies cercanas como de un amplio rango de organismos taxonómicamente alejados (Race et al., 1999., Lang et al., 1999., Bullerwell et al., 2004., Burger et al., 2007). La secuencia completa del cloroplasto de Nicotiana tabacum ha sido la primera revelada dentro de la familia de las Solanáceas (Z00044). Actualmente, se están llevando a cabo los proyectos de secuenciación del genoma nuclear y mitocondrial de Solanum lycopersicum (www.sgn.cornell.edu/about/tomato_sequencing.pl); Solanum tuberosum cv Spunta) y Solanum phureja (Potato Genome Sequencing Consortium - PGSC; www.potatogenome.net). El genoma cloroplástico, generalmente caracterizado por un alto grado de conservación, está compuesto por un único cromosoma circular de estructura cuatripartita, que incluye dos copias de una repetición invertida IR (IR1 e IR2) intercaladas con una región grande de copia única, LSC (large single-copy) y otra región corta de copia única, SSC (short single-copy) (Palmer, 1991; Raubeson-Jansen, 2005). Un estudio comparativo entre S. tuberosum cv. Desiree) y 6 especies de solanáceas evidenció que el contenido de genes y sus posiciones relativas son similares. Adicionalmente en el mismo trabajo, proponen que una deleción presente en S. tuberosum en la región LSC, es útil para diferenciarla del resto de las solanáceas.(Chung et al., 2006)