Aplicación de metodologías directas para el diseño de fármacos: técnicas de Docking y de dinamica molecular

GAVERNET LUCIANA; BRUNO-BLANCH LUIS E.

Capital Federal

Jornada; Jornada Científica Academia de Farmacia y Bioquímica; 2008

Las metodologías computacionales se han convertido en herramientas cruciales en el diseño de fármacos, ya sea para el descubrimiento de nuevas estructuras como para la optimización de compuestos conocidos. En particular las técnicas de docking implican la predicción de la conformación y orientación de un ligando dentro del sitio activo de una macromolécula, mediante la simulación de las interacciones que explican el reconocimiento molecular. Para esto resulta imprescindible contar con la estructura tridimensional de la macromolécula, hecho que cada vez resulta más factible dado el incremento constante del número de proteínas con estructura tridimensional conocida. El diseño de inhibidores de anhidrasa carbónica (CA) resulta un objetivo muy atractivo, dada la importancia de estas enzimas en los vertebrados. Compuestos con propiedades inhibitorias han sido utilizados como agentes anticonvulsivos, antiglaucoma, antiuroliticos, y anticancerígenos. La mayoría de los inhibidores más potentes presentan un grupo sulfonamida como función de anclaje al metal, pero recientemente se ha encontrado la funcion sulfamida como promisoria.Un conocimiento detallado de las interacciones sulfamida-sitio activo servirán de punto de partida para el diseño racional de inhibidores mas potentes. Es por ello que se realizo un análisis exhaustivo de las interacciones de seis sulfamidas con la enzima mediante tecnicas de Docking y dinámica moledular, a fin de lograr un mayor entendimiento de la razón de su actividad.