PRESENCIA DE ELEMENTOS INTEGRATIVOS Y CONJUGATIVOS ICE SXT Y ICE{SH95} EN ENTEROBACTERIAS

GERMÁN RAMOS PASSARELLO; CECILIA QUIROGA ; LEANDRO MARTÍN COLLIVADINO ; GISELA PARMECIANO DI NOTO ; FEDERICO TADDEO

Buenos Aires

Congreso; XV Congreso de Microbiología; 2019

Asociación Argentina de microbiología

PRESENCIA DE ELEMENTOS INTEGRATIVOS Y CONJUGATIVOS ICE SXT Y ICE{SH95} EN ENTEROBACTERIASLeandro Collivadino, Germán Ramos Passarello, Federico Taddeo, Gisela Parmeciano Di Noto, Cecilia Quiroga1.Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (UBA-CONICET)INTRODUCCIONLos elementos integrativos y conjugativos (ICE) son plataformas genéticas capaces de transferirse a distintos organismos. Existen diversas familias de ICEs siendo SXT/R391 una de las más estudiadas y distribuidas en el género {Vibrio} y en Enterobacterias. Estos elementos poseen varias regiones conservadas o {core}, tales como los genes de integración {int} y escisión {xis}, los genes de transferencia {tra} y los genes de regulación {set}. Sus regiones variables pueden codificar mecanismos de defensa, genes de resistencia a antibióticos y a metales pesados. Nuestro grupo caracterizó un nuevo ICE en la cepa clínica {Shewanella} sp. Sh95, denominado ICE{Sh95}, que codifica para un sistema de restricción y modificación, un operón de resistencia a metales pesados y un integrón de clase 4.OBJETIVOEl objetivo del presente trabajo fue analizar comparativamente el contenido genético entre los ICE SXT y ICE{Sh95}, y determinar su presencia en aislamientos clínicos de Enterobacterias.MATERIALES y METODOSLa búsqueda y análisis de las estructuras genéticas de los ICEs se hizo por blastn y blastp usando las secuencias completas de cada plataforma o las secuencias de las proteínas Int y Xis contra las bases de datos de Genbank. La construcción de árboles filogenéticos de las integrasas y escionasas de los ICEs se llevó a cabo usando el modelo de máxima verosimilitud con 1000 {bootstraps} con el programa MEGA V7. El análisis comparativo de las plataformas de los ICEs se hizo con el programa MAUVE. La búsqueda de los ICE SXT y ICESh95 en aislamientos clínicos de 20 Enterobacterias (6 {Providencia} spp., 10 {Klebsiella} spp., y 4 {Proteus} spp.) se realizó mediante PCR con {primers} específicos para los genes {int}_SXT, {int}_Sh95, {oriT} y setR}. RESULTADOSLa búsqueda de ICEs reflejó la presencia de un único homólogo al elemento híbrido ICE{Sh95} en los genomas de Enterobacterias, que correspondió al genoma de {Providencia rettgeri} PR_162 ya que su módulo {xis/int} era similar al de ICE{Sh95}. El ICE de PR_162 poseía además regiones variables distintas a las descritas para otras plataformas. Entre ellas se encontró un sistema de defensa tipo BREX-1. Además, se detectaron 3 ICEs del tipo SXT en los genomas de {P. rettgeri} 729/12, H1736 y NCTC7476. El análisis de Int y Xis de los distintos ICEs mostró que son cercanas a proteínas presentes en {Vibrio cholerae}. Por otro lado, la búsqueda de ICEs en aislamientos clínicos de Enterobacterias también resultó en la presencia de ambos elementos (ICE SXT y ICE{Sh95}) en el género {Providencia}. CONCLUSIONESNuestros resultados sugieren que los aislamientos de Enterobacterias pueden adquirir tanto ICE SXT como ICESh95. El análisis de las estructuras genéticas de estos elementos pone en evidencia su versatilidad y plasticidad. La similitud entre el ICE{Sh95} y el ICE PR_162 refleja su constante evolución y la posibilidad de incorporar genes de resistencia a antibióticos contribuyendo con esta problemática mundial.