Asociación entre las integrasas cromosómicas y sus sitios de recombinación

QUIROGA PAULA MARÍA ; GAMBINO ANAHÍ; CENTRÓN DANIELA; ALONSO FERNANDO

Mar del Plata

Congreso; IV CAMAyA-I MicroGen 2018; 2018

IV CAMAyA-I MicroGen 2018

Los integrones cromosómicos sedentarios se localizan usualmente de manera ubicua en el cromosoma de diferentes especies bacterianas, generalmente no patógenas y no asociadas a la multirresistencia antibiótica. Aproximadamente el 10% de los genomas depositados en GenBank contienen este tipo de integrones. Los genes cassettes (GC) de los integrones cromosómicos sedentarios son muy variados y sus Open Reading Frames generalmente contienen secuencias nucleotídicas cortas (400 a 600 pb). Por el contrario, los sitios de recombinación attC de un mismo integrón comparten un alto grado de identidad entre sí (>80%).Con el objetivo de estudiar la relación entre los las integrasas con sus sitios de recombinación se analizaron los integrones cromosómicos sedentarios de; Pseudomonas stutzeri, Pseudomonas alcaligenes, Shewanella oneidensis, Nitrosomonas europea, Xanthomonas campestris, Vibro rotiferianus, Vibrio fischeri y Vibrio vulnificus. Se utilizó el programa INTEGRON FINDER para detectar: C-In (integrones completos, Integrasa + attC), CALIN (clústeres de sitios attC que carecen de integraciones de integrón) e In0 (Integrasa solamente).Mediante el programa MEGA7 se realizó el análisis filogenético de los genes de las distintas integrasas (IntIs). A través del mismo se vió la cercanía evolutiva entre las secuencias aminoacídicas de las integrasas asociadas a la misma especie y género bacteriano, aunque la integrasa asociada a V. vulnificus presentó más similitud con las integrasas de Pseudomonas que con las de Vibrio. Por otro lado, llevamos a cabo un análisis filogenético de sus sitios attC asociados a estos integrones cromosómicos y los asociados a los principales GC de resistencia a antibióticos asociados a los llamados ?integrones móviles?. El resultado muestra que los sitios attC de los GC de resistencia a antibióticos se encuentran altamente emparentados con los sitios attC de S. oneidensis y Pseudomonas spp..Estos resultados evidencian que el resistoma de los GC asociados a multirresistencia antibiótica se halla sesgado hacia ciertos géneros bacterianos, particularmente Shewanella y Pseudomonas, de donde provendrían los más variados mecanismos de resistencia a antibióticos. Estos dos géneros constituyen un blanco relevante para el desarrollo de nuevas alternativas conducentes a la prevención de la diseminación de la resistencia a antibióticos.