El análisis de polimorfismos de simple nucleótido (SNPs) de la cepa A118 muestra una distribución homogénea de recombinación a lo largo del todo genoma

TRAGLIA G.; CENTRON D.; TOLMASKY M.E.; RAMIREZ M.S.

Buenos Aires

Congreso; Congreso Argentino de Microbiología 2013; 2013

Asociación Argentina de Microbiologia

Recientemente se ha observado un incremento en infecciones nosocomiales causadas por cepas de Acinetobacter baumannii (Ab) resistentes a todos los antibióticos disponibles para su tratamiento. Este hecho despertó sumo interés en el estudio de esta bacteria y trabajos recientes en los cuales se análizaron y compararon genomas de varios aislamientos demostraron que existen una gran plasticidad y variabilidad genética. Esta podría ser la causa de la capacidad de Ab de adquirir rápidamente diferentes genes y determinantes que le permiten persistir y adaptarse al ambiente hospitalario. En el año 2008 hemos identificado y caracterizado a la cepa A118, que dadas sus características particulares de amplia susceptibilidad antibiótica y competencia natural, fue propuesta como modelo para estudios genéticos. En el presente trabajo realizamos un análisis genómico de la misma a fin de evidenciar la presencia de eventos de recombinación y plasticidad genética en A118. Dada la cercanía filogenética, seleccionamos como cepa de referencia para llevar a cabo la comparación genómica la cepa ATCC 17978. Las comparaciones genéticas se utilizaron los programas Mapsolver y Mauve que permiten analizar mapas de alta resolución y secuencias genómicas, respectivamente. Los resultados obtenidos mostraron la presencia de 12 inversiones, 206 inserciones y al menos 626 deleciones entre ambos genomas. Además se evidenciaron diferencias en cuanto al ordenamiento genético entre ambas cepas. Por otra parte se detectaron 33 regiones denominadas ?bloques colineares colocalizados? los cuales estarían libres de arreglos genéticos. Asimismo se identificaron 43784 SNPs a lo largo del todo el genoma con una distribución homogénea. En conclusion, el análisis genómico descripto en este trabajo demostró que existe una gran dispersión homogénea de SNPs a lo largo de ambos genomas, indicativo de un elevado nivel de recombinación entre las dos cepas comparadas a pesar de su cercanía filogenética. Estos resultados confirman la existencia de una elevada plasticidad genética intrínseca y una gran variabilidad intra-especie en Ab.