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Cryptosporidium constituye la principal causa mundial de diarrea parasitaria en humanos y bovinos. Presenta numerosas especies dentro de las cuales C. parvum reviste importancia zoonótica y produce importantes pérdidas pecuarias ya que afecta a terneros menores de 60 días. En Argentina su prevalencia estimada fue de 16-29%, siendo Buenos Aires la provincia en la que se localizan la mayor parte de los estudios. Los objetivos del trabajo fueron: Estimar la prevalencia de infección por Cryptosporidium sp. en rodeos lecheros pertenecientes al partido de Luján por detección microscópica y biología molecular; determinar los factores epidemiológicos asociados a su transmisión e identificar especies de Cryptosporidium en muestras de materia fecal bovina mediante la secuenciación de los productos de PCR-touchdown.Se recolectaron muestras de materia fecal de terneros Bos taurus, raza Holando Argentino en etapa de crianza de cuatro establecimientos lecheros del partido de Luján, provincia de Buenos Aires. Se realizaron encuestas epidemiológicas a sus propietarios con el fin de recabar datos acerca de las características generales de las guacheras y de la crianza. Para estimar la prevalencia de infección, se investigó la presencia de ooquistes coloreados con Kinyoun en frotis de materia fecal. El genotipo parasitario se determinó por amplificación y secuenciación de un fragmento del gen de la subunidad menor 18S de ARNr de Cryptosporidium sp. mediante la técnica de PCR-touchdown. Mediante un estudio de riesgo (Odds ratio) se determinaron los factores predisponentes para adquirir la infección.La prevalencia general obtenida fue de 27%, hallándose diferencias entre los establecimientos estudiados (6,25-60%; p=0,024). El análisis de riesgo demostró que las condiciones de manejo, el tipo de crianza, la alimentación y las características particulares de la guachera representan factores epidemiológicos relevantes en la transmisión parasitaria, y que la infección por Cryptosporidium sp. constituye un factor de riesgo asociado al desarrollo de diarrea. Mediante la técnica de PCR-touchdown se obtuvo un valor de prevalencia general de 16%. En todos los establecimientos fue prevalente C. parvum y en uno de ellos también se detectó C. bovis en menor proporción. El hallazgo de la especie zoonótica C. parvum junto con la identificación de factores relevantes que condicionan su transmisión resultan fundamentales para diseñar estrategias de control capaces de mitigar y prevenir los efectos de la infección en rodeos lecheros del partido de Luján, evitar potenciales eventos de transmisión zoonótica y controlar la contaminación del medio ambiente con ooquistes.