"El Caballo de Troya? Serratia marcescens, caracterización del plásmido pSM938 portador de la metalo BETA-lactamasa blaNDM-1"

ANAHI S GAMBINO; DANIELA CENTRÓN; MARÍA PAULA QUIROGA; ADRIÁN GONZALEZ MACHUCA

BUENOS AIRES

Congreso; II Jornadas de Microbiología Celular y Molecular 2021. Asociación Argentina de Microbiología (AAM); 2021

AAM

La resistencia bacteriana a antimicrobianos (RAM) es una amenaza para la salud en el mundo entero. Existe una amplia variedad de genes de resistencia antimicrobianos (GRA) que aportan a la RAM, siendo la metalo β-lactamasa Nueva Delhi tipo 1 (blaNDM-1) de las más relevantes a nivel infectológico ya que está altamente asociada a fracaso terapéutico. Si a esta situación se le suma que la especie portadora del gen es S. marcescens, que es intrínsecamente resistente a antibióticos como el colistin, estamos frente a un serio problema ya que las opciones terapéuticas se encuentran extremadamente limitadas. En este estudio, tenemos como objetivo caracterizar elementos móviles asociados a RAM en el aislamiento clínico S. marcescens SM938 extremadroga resistente (XDR) que alberga blaNDM-1. Para ello, la cepa fue secuenciada con la tecnología Miseq. Las lecturas se ensamblaron con SPAdes 3.9.0 y el genoma se anotó con Prodigal. Se utilizó la base de datos RefSeq para la anotación del mismo y se completó utilizando BLASTn. Para la búsqueda de plásmidos y secuencias de inserción se utilizó PlasmidFinder e ISfinder. Por otro lado, los GRA se identificaron con RESfinder, CARD y BLASTn. Además, se llevó adelante la caracterización in vivo del aislamiento para corroborar el fenotipo de resistencia, se realizaron ensayos de conjugación plasmídica usando como receptoras a las cepas E. coli J53 y S. marcescens SCH909, y se estudió también el mantenimiento del plásmido por las cepas transconjugantes.Al estudiar el conjunto de reads, logramos ensamblar un total de 74 contigs. Dos de ellos estaban relacionados entre sí y emparentados con plásmidos. Al unir estos contigs con PCR específicamente diseñadas para este fin, identificamos al plásmido pSM938 de 137.269 pb y un contenido G+C de 52,0 %, menor al G+C total de los contigs de 59,7%. Al profundizar en el estudio del plásmido pSM938, encontramos que pertenece al grupo de incompatibilidad IncC tipo 1a. Haciendo una búsqueda en la base de datos de NCBI encontramos que no se ha reportado otro plásmido idéntico a pSM938. Posee el módulo de conjugación completo con su sistema de secreción intacto y dos módulos con genes accesorios. Uno de los módulos accesorios posee una variante de la secuencia de inserción (SI) ISEcp1 que lleva dentro al GRA blaCYM-6. El segundo módulo accesorio es un mosaico de SI y transposones que se encuentra invadiendo al gen rhs, el cual alberga los GRA aac(6?)-Ib10, sul1 y qacEΔ1 dentro de un integrón de clase 1 y además contiene al gen blaNDM-1.En los estudios in vivo encontramos que el plásmido pSM938 es transferible por conjugación tanto a E. coli J53 como a S. marcescens SCH909. En ambos casos las cepas transconjugantes resultantes presentaron resistencia a carbapenemes y cefalosporinas de cuarta generación.Aquí, describimos un aislamiento clínico XDR de S. marcescens SM938 que alberga blaNDM-1 en un plásmido altamente conjugativo colocando a S. marcescens en un papel de importancia en el ambiente intrahospitalario.