Epidemiologia basada en aguas residuales: dinámica de circulación poblacional de SARS-CoV-2 y sus variantes de preocupación (VOC) en la Ciudad de Córdoba Capital y Valle de Punilla

MARINZALDA M, CACHI A, CASTRO G, SICILIA P, IBARRA G, ROJAS R, LOPEZ L, BARBÁS G, ; RÉ V, ; MASACHESSI G

Jornada; XXII Jornadas de Investigación Cientifica.; 2021

Estudios recientes demostraron que las células entéricas son blanco para la infección por SARS-CoV-2, debido a que expresan el receptor celular para el virus (ACE2), permitiendo la replicación viral en el tracto gastrointestinal. Otros estudios reportan que el 35% de pacientes infectados con SARS-CoV-2 (sintomáticos y asintomáticos), excretan el virus por materia fecal, con un tiempo medio de excreción de 17 días. De esta manera, las aguas residuales constituyen una matriz que resume la excreción poblacional del virus. Objetivo: Estudiar la dinámica de circulación poblacional de SARS-CoV-2 y sus variantes de preocupación (VOC) en aguas residuales de la Ciudad de Córdoba Capital y Valle de Punilla. Materiales y Métodos: Muestreo: Desde el mes de mayo del año 2020, al presente, se recolectaron 313 muestras de aguas residuales crudas del conducto de la red central que ingresa a la planta depuradora de la ciudad de Córdoba (n= 130) y a las plantas de Carlos Paz (n=61), Valle Hermoso (n=61) y La Falda (n=61), en Valle de Punilla. Frecuencia de recolección: semanal. Concentración de SARS-CoV-2 en aguas residuales: elusión y precipitación con polietilenglicol 6000, seguido de centrifugaciones diferenciales a 4°C. Extracción de ARN: MagNAPure 96 - Roche. Detección genómica: DisCoVery SARS-CoV-2RT-PCR Detection Kit gen N y LightMix® Modular SARS and Wuhan CoV E-gene kit. Detección de variantes por RT-PCR en tiempo real: TaqMan? SARSCoV-2 Mutation Panel (AppliedBiosystems) para detección de VOCs Alpha, Beta y Gamma. Resultados y Conclusiones: Se detectó RNA viral en el 38% de las muestras analizadas (28% Córdoba, 45% Valle de Punilla).La detección del genoma de SARS-CoV-2, a través de los valores de Ct, se correlacionó con la curva epidemiológica de casos clínicos reportados entre los meses analizados, comenzando a ser detectado en aguas hasta dos semanas antes del aumento exponencial de casos clínicos tanto en la primera y segunda ola como en el brote estival en todas las localidades. Este valor predictivo de olas epidémicas podría explicarse por un número significativo de excretores asintomáticos y pre-sintomáticos. Además, el estudio de las aguas residuales describió la dinámica de circulación de las variantes virales (VOC) en laslocalidades estudiadas.