Identificación de un nuevo subgenotipo del virus de hepatitis B genotipo F a partir de muestras de pacientes con infección crónica de Argentina

MOJSIEJCZUK, L.N., ; TORRES, C, ; RÉ, V,; PISANO, M.B., ; FAINBOIN, H.A; GALDAME, O.A. ; CAMPOS RH; FLICHMAN, D.M.

BS AS

Congreso; XI Congreso Argentino de Virología II Congreso Latinoamericano de Virología.; 2015

SOC. ARGENTINA DE MICROBIOLOGIA

El virus de lahepatitis B (HBV) se clasifica en ocho genotipos (A-H) en base al análisis dedistancias genéticas entre secuencias de genoma viral completo. El genotipo F, consideradooriginario de los pueblos nativos americanos, es uno de los más prevalente deArgentina y hasta la actualidad se ha clasificado en cinco subgenotipos (sgt)denominados F1 a F5. El objetivo de este trabajo fue realizar unacaracterización y análisis evolutivo de seis genomas completos del HBV genotipoF. Tres de ellos fueron aislados de pacientes residentes en la Ciudad de BuenosAires y, los restantes, en la Provincia de Córdoba. Las secuencias, junto areferencias obtenidas de GenBank, fueron alineadas (ClustalX v2.1) y editadas(BioEdit v7.1.3.0). El posible origen recombinante de las secuencias se evaluócon el programa Simplot v3.5.1. Se realizó un análisis filogenético por elmétodo de Máxima Verosimilitud (PhyML v3.0), se calcularon las distanciasgenéticas entre grupos (MEGA6) y se llevó a cabo un análisis de coalescencia pormetodología bayesiana (paquete BEAST v1.7.5). Como resultado del análisisfilogenético, se observó que los seis aislamientos formaron un grupomonofilético dentro del genotipo F, con alto soporte estadístico, pero separadode los demás sgt descriptos hasta el momento. Las distancias genéticascalculadas entre el nuevo grupo y secuencias de referencia del genotipo F se encontraronentre el 4,03 %, respecto al sgt más cercano: el F4, y 6,20% en relación al sgtF1. A lo largo del genoma, las seis secuencias presentaron 19 posicionesnucleotídicas únicas y características, no observadas en los demás sgt. En loscuatro marcos abiertos de lectura que presenta el genoma de HBV, dichassustituciones generan 12 cambios por codones sinónimos y 11 no sinónimos. Enbase a estos últimos, se puede establecer un patrón de aminoácidos únicos ycaracterísticos del nuevo grupo: sp254L, sp271K, sp314P, rt21I, rt132D, rt261E, rt277R, rh743R y rh807Len la polimerasa viral, 91N en PreS1 y 47S en la proteína X. Por otra parte, elanálisis de coalescencia situó al ancestro común más reciente (ACMR) del nuevo grupoen el año 1030 d.C. [HPD95%=1386-480 d.C.], con una diversificación entre losaños 1100 a 1430, lo que coincide con el período de expansión poblacional delos demás sgt reconocidos del genotipo F. Dadas las actuales recomendacionespara la clasificación del HBV que asigna como nuevo subgenotipo a un grupomonofilético, con soporte estadístico y con distancia genética entre 4.0 y 7.5%con los grupos anteriormente reportados, se propone que los seis genomasdescriptos en este trabajo componen un nuevo sgt del HBV: el sgt F6. Laidentificación de nuevos subgenotipos permite profundizar los conocimientossobre la historia evolutiva del HBV, así como clarificar la relación entre los(sub)genotipos virales y la historia natural de la infección.