Origen y diversificación del virus de la hepatitis genotipo 2c en Córdoba, República Argentina.

CULASSO A; RÉ V; CONTIGIANI M; CAMPOS R

Buenos Aires

Congreso; XII Congreso Argentino de Microbiología; 2010

Asociación Argentina de Microbiología

La infección crónica con el Virus de la Hepatitis C (HCV) esta asociada a patologías hepáticas severas que incluyen el carcinoma hepatocelular. La elevada diversidad genética del HCV ha permitido definir 6 genotipos (1 al 6) y numerosos subtipos (a, b, c, etc.). Los genotipos 1, 2 y 3 tienen distribución cosmopolita. El genotipo 2 se halla en África occidental y en el sur de Europa representado por numerosos subtipos. El genotipo 2c tiene una distribución mundial como genotipo minoritario. Por el contrario, en Italia es el segundo genotipo en prevalencia (después del 1b). Estudios previos en la provincia de Córdoba revelaron que aproximadamente el 50% de las infecciones están asociadas al subtipo HCV-2c pero en Cruz del Eje es el genotipo mayoritario (~90%) El objetivo de este trabajo es el estudio del origen y la diversificación del HCV-2c en la Provincia de Córdoba utilizando análisis filogenéticos y de coalescencia Se analizaron 92 muestras de suero de personas de Cruz de Eje (positivas para HCV) en un estudio epidemiológico previo (año 2004) y 53 muestras de suero de pacientes que concurrieron para diagnóstico virológico al Servicio de Virología del Instituto Dr J. M. Vanella desde distintos puntos de esta provincia. Secuenciación: Sobre el ARN viral del suero se realizó una retrotrascripción con cebadores aleatorios. El ADNc fue amplificado (reacción anidada de PCR) en un fragmento de 367 pb de la región NS5B. Los amplicones se secuenciaron de manera directa (Macrogen Inc.). Análisis Filogenéticos: Las secuencias obtenidas junto con otras provenientes del Genbank de África y Europa se sometieron a análisis filogenético por métodos de Distancia (MEGA 4), Máxima Verosimilitud (PhyML 3.0) y Parsimonia (TNT). Análisis de Coalescencia: Se infirió por métodos Bayesianos la edad del ancestro común más reciente y la demografía del HCV-2c (BEAST 1.4.8) utilizando una tasa de 5x10-³  sustituciones por sitio por año para calibrar un reloj molecular relajado. Resultados Los tres métodos de análisis filogenéticos reprodujeron una topología donde todas las muestras cordobesas junto a las europeas (Francia, Italia principalmente) y las africanas conforman un único grupo sin clusters internos. El análisis de coalescencia que se realizó sobre tres grupos de secuencias: Cruz del Eje (CdE), de otras ciudades cordobesas (OLC) y de Francia (Fr) permitió estimar la edad de los ancestros comunes para los tres grupos en aproximadamente 150 años (~1860 D.C.) y permitió proponer un modelo demográfico cuya fase exponencial cubre un lapso de tiempo de 60 años entre 1890 y 1950. Conclusión: El análisis filogenético muestra la ausencia de diversidad asociada al espacio geográfico (no se observan clusters de secuencias distintos para secuencias de CdE, de OCL ni de Francia o de Italia) sugiriendo que el proceso de diversificación es un evento reciente. La fase exponencial de crecimiento en el número efectivo de infecciones para los tres grupos de secuencias analizadas coincide con el proceso de emergencia mundial demostrada para diversas infecciones, en particular para el HCV-1b, resultante del proceso de globalización ocurrido a partir de principios del siglo XX (transfusiones, tratamientos inyectables, migraciones masivas, tránsito e intercambios, drogadicción). El  análisis filogenético, de coalescencia, la epidemiología y la historia inmigratoria sugieren, que los HCV-2c detectados en CdE y OLC resultan de la introducción del virus desde Italia durante el proceso migratorio de principios del siglo XX (1860-1920). Luego de este proceso, los ancestros comunes en distinta localización geográfica, se diversifican, en cada espacio geográfico, siguiendo el proceso de emergencia de infecciones consecuencia del proceso de globalización ocurrido en los últimos 80 años.