Estudio de la Estructura y Diversidad Microbiana de Ambientes Acuáticos Naturales de la Región Centro de Nuestro País.

REYNA, L.; LINARES, M.; WUNDERLIN, D. A.; GENTI-RAMONDI, S.

Los Cocos. Córdoba.

Simposio; I° Simposio SETAC Argentina, Ecotoxicologia Y Contaminación.; 2006

SETAC ARGENTINA

Los microorganismos comprenden la mayor diversidad biológica del planeta. Se estima que más del 99% de estos no pueden ser cultivados en el laboratorio. Es por ello, que los métodos de análisisindependientes del cultivo son esenciales para entender la diversidad, estructura e importancia biológicade la mayoría de ellos. En el presente estudio se utilizaron dos metodologías independientes de cultivo: PCR-DGGE (denaturing gradient gel electrophoresis) y RISA (ribosomal intergenic spacer regionanálisis) a los fines de analizar los diversidad de la comunidad microbiana presente en la cuenca del RíoPrimero de Córdoba, Argentina. Las muestras de agua fueron recogidas entre los meses de noviembre de 2005 a setiembre 2006 en diferentes puntos del recorrido del río. El ADN bacteriano se extrajo mediante procedimientos estándares. Fragmentos de los 16SADN, que incluyen las regiones variables V3-V5fueron amplificados mediante PCR y analizados por DGGE. Por otro lado, los productos de PCR amplificados con los primers universales de las eubacterias, que permiten amplificar las secuenciascomprendidas entre las subunidades pequeñas (16S) y grande (23S) de los genes rRNA (RISA), fueron analizados mediante electroforesis en geles de poliacrilamida. Los resultados obtenidos muestran cambios en la diversidad microbiana del río a su paso por la ciudad de Córdoba que se correlaciona con los cambios físico-químicos previamente analizados (demanda biológica y química de oxígeno, oxígeno disuelto y contenido de amonio, nitrito y nitratos, etc.). Las bandas de ADN más relevantes presentes en los DGGE y RISA fueron cortadas y eluidas del gel. Dosde ellas han sido clonadas y los clones obtenidos analizados mediante RFLP (restriction fragment lengthpolymorphism). Al presente se están analizando la secuencia de nucleótidos de los fragmentos contenidosen dichos clones a los fines de compararlos con las secuencias depositadas en la bases de datos. Este trabajo representa el primer análisis metagenómico que se realiza en un ambiente acuático local a los fines de establecer relaciones filogenéticas de su diversidad microbiana.