Análisis de marcadores genéticos en una población de caballos Criollo Chaqueño expuestos a Anemia Infecciosa Equina

DIAZ S; LOPEZ RA; SADABA SA; KALEMKERIAN PB; CARINO MH; VILLEGAS-CASTAGNASSO EE; FRANCISCO EI; BOFFI F.; GIOVAMBATTISTA G; PERAL-GARCIA P

Ciudad de Buenos Aires

Congreso; XXII Conferencias de Veterinaria Equina.; 2011

Asociacion Argentina de Veterinaria Equina

Introducción: La caracterización genómica es un objetivo básico para determinar asociaciones con enfermedades infecciosas, por lo que la primera etapa fundamental de un estudio de asociación consiste en determinar el perfil genético de la población caballar en estudio. Para este fin, se utilizan estrategias de rastreo genético que consisten en el análisis de marcadores genéticos (MG) distribuidos en todo el genoma, así como marcadores candidatos, tales como los genes relacionados con la respuesta inmune. Objetivo: Caracterizar a nivel molecular-poblacional marcadores genéticos en una muestra de caballos chaqueños expuestos a Anemia Infecciosa Equina (AIE) para determinar su composición genómica como prerrequisito para determinar asociaciones con AIE. Material y Método: se utilizaron 50 muestras de equinos pertenecientes a dos establecimientos de la Provincia de Chaco, tomadas en tres 3 campañas durante los años 2008 y 2009. La serología diagnóstica para AIE se realizó mediante el test de Coggins en laboratorios habilitados por SENASA. El ADN genómico de purificó a partir de las muestras de sangre siguiendo las recomendaciones del kit (Axygen). Para el estudio se analizaron un total de 18 MG mediante dos estrategias: 1) rastreo genómico mediante 12 MG microsatélites recomendados por la International Society for Animal Genetics (ISAG) y estandarizados para identificación equina, y 2) análisis de 6 MG inmunes candidatos, como citoquinas (TNF, ILs), genes del Complejo Principal de Histocompatibilidad equino (ELA) y microsatélites ligados en el mismo cromosoma. Para la genotipificación se utilizaron metodologías de Secuenciación capilar, Pirosecuenciación y Análisis de fragmentos. El análisis estadístico se realizó con los programas de análisis poblacional Arlequín (ver 3.11, Excoffier 1998-2007) y Genepop (Rousset 2008). Resultados: se determinó la composición genómica mediante estimación de las frecuencias génicas, genotípicas y parámetros de diversidad genética (heterocigosis-He, na) para cada marcador. El análisis poblacional en los dos establecimientos y en los grupos de animales AIE (+) y AIE (-) permitió caracterizar la variabilidad de todos los MG, especialmente de los genes inmunes. Las estimaciones se compararon con otras razas equinas, y mostró valores promedio de He=0,7 y na=5. Se observó la distribución diferencial de determinados alelos de los MG, lo que deberá confirmarse mediante análisis de segregación familiar. Conclusiones: la población de caballos chaqueños muestra un perfil genético característico, presentando un importante grado de variabilidad genética tanto a nivel de los MG genómicos como en los genes relacionados con la respuesta inmune. Este grado de variabilidad genética colocaría a los caballos chaqueños en una posición favorable para afrontar infecciones, es decir, poseen mayor plasticidad genética que podría ser beneficiosa en la determinación de resistencia/susceptibilidad a la infección por AIE. Si bien la caracterización de genes candidatos se realizó con 6 marcadores que abarcan las distintas regiones del MHC equino, aumentar el número de marcadores en cada región aportaría datos más concluyentes para determinar la existencia de asociación genética con la infección.