Identification and characterization of long noncoding RNA associated proteins

MICHAËL MOISON; MARTIN CRESPI; CAMILLE FONOUNI FARDE ; LEANDRO LUCERO; MARÍA FLORENCIA LEGASCUE; FEDERICO ARIEL

Buenos Aires

Workshop; Workshop de Biología Celular y Molecular del ARN 2018; 2018

Fundacion Instituto Leloir

ElARN largo no codificante lncRNA APOLO participa en la regulación dinámica de la conformación tridimensional de la cromatina enArabidopsis Se sabe que para tal fin, este transcripto interactúa con una proteína del Complejo Represivo Polycomb 1 (PRC 1 llamada LHP 1 Conel objetivo de dilucidar los complejos ribonucleoproteicos en los que interviene APOLO llevamos a cabo una Purificación de la Cromatina apartir de ARN (del inglés, ChIRP seguida de espectrometría de masas Como resultado, obtuvimos una lista de 16 proteínas que potencialmentereconocen a APOLO in vivo, incluyendo distintas proteínas asociadas a la cromatina, otras del metabolismo del ARN y tres factores detranscripción Entre ellas, identificamos a tres proteínas pertenecientes a la súperfamilia RING Mediante ensayos de expresión transitoria enhojas de tabaco, hemos analizado la interacción entre cada una de las proteínas con dominio RING y el ARN largo APOLO Por lo pronto, hemosvalidado la interacción mediante Inmunoprecipitación del ARN ( y TriFC (una técnica derivada del BiFC Bimolecular FluorescenceComplementation mediada por un ARN) de una E 3 ubiquitin ligasa con APOLO Se sabe que esta proteína es capaz de unir a ADN metilado invivo e in vitro, y ha sido vinculada al desarrollo de raíces y al tiempo de la floración Proponemos una serie de experimentos en Arabidopsis paradilucidar el impacto de la interacción APOLO proteína en la conformación tridimensional de la cromatina