Estudio de bloques de homocigocidad en toros Retinta Española de alta y baja endogamia

ANTONIO MOLINA; DANIEL GOSZCZYNSKI; ESTER MERCEDES TERAN; SEBASTIAN DEMYDA PEYRÁS

Córdoba

Congreso; II CONGRESO DE VETERINARIA Y CIENCIA Y TECNOLOGÍA DE LOS ALIMENTOS; 2018

Universidad de Córdoba

p { margin-bottom: 0.25cm; line-height: 120%; }a:link { }ntroduccióny objetivosEnla actualidad las actividades de mejora en animales de ganadería hanprovocado una disminución de la variabilidad genética y aumento deendogamia. Se ha demostrado que, en cierto nivel, el aumentohomocigosidad produce efectos deletéreos en característicasreproductivas (Dorado et al 2015). Un método para cuantificar laendogamia es a través de bloques de homocigocidad (ROH, runs ofhomocigocity) que se distribuyen por todo el genoma.Elobjetivo del trabajo fue comparar la proporción y distribución debloques de homocigocidad en toros de la Raza Retinta de alta y bajaendogamia y su posible relación con la disminución en lafertilidad.Materialesy MétodosSetomaron muestras de sangre de 54 toros pertenecientes a la AsociaciónNacional de Criadores de Ganado Vacuno Selecto de Raza Retinta(ACRE). Los animales se dividieron en dos grupos en base a su nivelde endogamia (alta y baja) calculada a partir del pedigrí.Lasmuestras fueron genotipificadas usando el array de SNP de altadensidad Axiom® Genome-Wide BOS 1 Bovine (Affymetrix, Santa Clara,Ca, USA) el cual cuenta con 641,520 SNPs.Seestimaron los ROH usando el software cgaTOH (Zhang et al. 2013) y seclasificaron en 5 categorías: 1?2, 2?4, 4?8, 8?16, and >16Mb. También se calculó el índice de endogamia basado en ROH(FROH). Finalmente, se realizaron análisis de anotación funcionalpara identificar vías biológicas relevantes.Resultadosy ConclusionesLadistribución de ROH fue muy variable entre cromosomas e individuos.En los animales con alta endogamia se observó una acumulación deROH significativa en algunas regiones, mientras que en otras huboausencia total de los mismos. El análisis de anotación funcionaldemostró que las regiones enriquecidas en ROH estaban relacionadas ala motilidad celular, reorganización del citoesqueleto y metabolismolipídico. Lo que se correlaciona con estudios previos.Lomás relevante fue que individuos con el mismo FROH tambiénpresentaban una distribución de ROH desigual, lo sugiere que elnivel de endogamia podría no ser un buen predictor de la depresiónpor endogamia.Referencias1)Dorado J. etal., Reprod,Fertil and Dev 2015;29(4): 712?20. 2) ZhangL. et al., PLoSONE2013; 8.