INVESTIGADORES
VILLARREAL Marcos Ariel
congresos y reuniones científicas
Título:
Dinámica Molecular de (Lys)3 y (Lys)5 en Solución Acuosa
Autor/es:
VILLARREAL MA; MONTICH GG
Lugar:
La Cumbre. Córdoba.
Reunión:
Congreso; XXVIII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biofísica.; 1999
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Biofísica
Resumen:
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Existen muchos ejemplos de proteínas periféricas
de membrana que interactúan con fosfolípidos aniónicos
a traves de dominios enriquecidos en aminoácidos básicos.
Generalmente, la actividad biológica de estas proteínas
esta regulada por cambios conformacionales que ocurren acoplados a la
unión de estos dominios. Con el objeto de estudiar algunos de
aspectos estructurales y termodinámicos de esta interacción
hemos iniciado simulaciones de dinámica molecular de péptidos
que contienen residuos básicos en solución y unidos a
membranas. En este trabajo presentamos las dinámicas de tri- y
penta-lisinas en solución. Utilizamos el campo de fuerza
CHARMM y solvente explícito. En diferentes corridas, se
consideraron cadenas laterales con carga 0 y +1. Se agregaron
contraiones Na+ para mantener la electroneutralidad del sistema. Se
eligieron estructuras iniciales cuyos ángulos corresponden a
hélices-alfa y cadenas-beta con cadenas laterales
completamente extendidas. Se corrieron dinámicas de 1 ns de
duración. El resultado mas notable de estas simulaciones es
que las cadenas laterales de lisinas tienden a agruparse,
contrariamente a lo que podría esperarse debido a la repulsión
eslectrostática entre los grupos NH3+. Resultados
similares han sido obtenidos por Vila y col. Utilizando una búsqueda
conformacional (Biophys. J. 1998 75 2637). La explicación
más inmediata de esta observación es que la energía
ganada por remoción de zonas hidrofóbicas del contacto
con el solvente acuoso es suficientemente grande como para permitir
el acercamiento de los grupos cargados. En ninguna de nuestras
simulaciones se observan transiciones que involucren cambios en la
estructura de hélice alfa o cadena beta.
Con subsidios de CONICET, SECYT-UNC y FONCYT. MV es
becario de CONICOR.
