INVESTIGADORES
CAROBENE Mauricio
congresos y reuniones científicas
Título:
ANÁLISIS DEL MOSAICISMO GENETICO DE FORMAS RECOMBINANTES INTERSUBTIPO B/F DEL HIV-1 EN LA ARGENTINA.
Autor/es:
QUARLERI JF; RUBIO A; CAROBENE M; TURK G; VIGNOLES M; SALOMON H; GOMEZ-CARRILLO M
Lugar:
Buenos Aires, Argentina
Reunión:
Congreso; VI Congreso Argentino de Sida; 2003
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Sida
Resumen:
Objetivo: Estudiar la estructura del mosaicismo genético a nivel del gen pol del HIV-1 presente en la forma recombinante intersubtipo BF y, su frecuencia relativa. Materiales y métodos: Se analizaron 587 secuencias genómicas parciales del gen pol (2252-3749 HXB2) obtenidas de pacientes en falla terapéutica. Estas fueron obtenidas por RT-PCR y posterior secuenciación automática. Los procedimientos de inferencia filogenética fueron efectuados a partir de matrices de distancia siguiendo el algoritmo de Neighbor-joining. Definido el subtipo viral, se analizaron los patrones de recombinación por bootscanning con el programa SimPlot 2.5. Resultados: La caracterización molecular del HIV-1 a nivel del gen pol evidenció que el 50,94% (n=299) correspondió al subtipo B y 48,38% (n=284) a recombinantes BF. Sólo 4 secuencias resultaron ser “no B - no BF” (0,68%). Las formas recombinantes BF exhibieron al menos, 3 patrones de mosaicismo genético con diferente frecuencia relativa de cada uno de ellos. Conclusiones: Se advierte una alta prevalencia de secuencias virales con mosaicismo genético BF en el gen pol del HIV-1. Entre éstas, coexisten diferentes estructuras, entre las que predomina aquella semejante a la forma recombinante circulante descripta previamente en Argentina (CRF_12). Se nota la presencia de breakpoints intersubtipo conservados en los diferentes dominios del gen pol en cada mosaico hallado. En el mosaico “I” el dominio codificante de la transcriptasa reversa (RT-p51) exhibe en su extremo 5’ predominio del subtipo F, y en el extremo 3’ del subtipo B. En ambas residen mutaciones asociadas a resistencia en modo “subtipodependiente” (aa 41-118 en el subtipo F; aa 151-236 en el subtipo B), lo cual explicaría la mayor abundancia relativa de esta forma en los pacientes con falla terapéutica que fueron estudiados.