Caracterización genética de Akodon azarae y Calomys laucha en poblaciones de campos bajo manejo convencional y orgánico del centro de Argentina mediante RadSeq

CHIAPPERO, M.B.; VERA, N.S.; MÜLLER, R.A.; CODA, J.A.; PRIOTTO, J.W.

Jujuy

Congreso; XXXIV Jornadas de la Sociedad Argentina de Mastozoología; 2023

Sociedad Argentina para el estudio de los mamíferos

En trabajos anteriores encontramos que poblaciones de bordes de campos bajo manejo orgánico (CMO), mostraron mayor riqueza y abundancia de especies de micromamíferos, y hembras con mayor actividad reproductiva, que las de bordes de cultivo bajo manejo convencional (CMC). El uso de agroquímicos en CMC podría determinar presiones selectivas particulares. Pero para que ocurra diferenciación genética en loci bajo presiones selectivas locales, el flujo y la deriva genéticas deben ser débiles respecto a estas. Utilizamos SNP obtenidos mediante RadSeq para caracterizar la variabilidad y estructura genética y detectar loci potencialmente bajo selección natural, en poblaciones de Calomys laucha (especialista de cultivos) y Akodon azarae (generalista de hábitat) de CMC y CMO. El objetivo fue evaluar si estas especies son modelos adecuados para estudiar presiones selectivas diferenciales en estos ambientes. Se tomaron muestras en tres establecimientos rurales con lotes con ambos tipos de manejo. Luego del control de calidad, alineado de novo y filtrado de SNPs, permanecieron en el análisis 38.233 SNP y 28 individuos de C. laucha, y 22.778 SNP y 32 individuos de A. azarae. El análisis con el módulo “populations” del programa STACKS reveló niveles algo menores de variabilidad genética en las 4 poblaciones de C. laucha (Ho=0,061-0,084) en comparación con las de A. azarae (Ho=0,085-0,099). La diferenciación genética entre pares de poblaciones fue moderada en ambas especies (C. laucha: FST entre 0,064 y 0,098; A. azarae: FST entre 0,05 y 0,099). Akodon azarae mostró correlación positiva y significativa entre FST y distancia geográfica (r=0,22, p=0,041) mientras que C. laucha no. El programa Bayescan identificó 6 loci potencialmente sujetos a selección natural (FDR=0,10) en C. laucha y ninguno en A. azarae. En A. azarae nuestros resultados coinciden con los obtenidos previamente con microsatélites, y confirman la gran capacidad de dispersión de la especie. Por ello, sólo podrían detectarse loci bajo presiones de selección lo suficientemente grandes como para superar el efecto del flujo génico. C. laucha mostró valores de FST similares a A. azarae pero la diferenciación es al azar respecto a la distancia geográfica, evidenciando menores niveles de flujo génico que permitirían la diferenciación local de loci sujetos a selección natural. Esta especie sería por lo tanto un mejor modelo para estudiar el efecto del tipo de manejo sobre las poblaciones naturales