Análisis del polimorfismo y la divergencia nucleotídica de Lsd-2, un gen candidato para el tamaño corporal

CARREIRA, VP; CORIO, C.; RUSSO G; FANARA JJ; HASSON E

Belem

Congreso; VII Simposio de Ecologia, Genética y Evolución de Drosophila; 2011

El tamaño del cuerpo es un carácter adaptativo cuya variación tiene base genética, depende de factores ambientales y muestra múltiples interacciones con otros componentes del fitness. En trabajos previos, hemos estudiado la variación de diferentes caracteres vinculados al tamaño corporal en líneas derivadas de poblaciones naturales de D. melanogaster dispuestas a lo largo de gradientes geográficos de Argentina y hemos identificado genes candidatos a participar en su expresión. En este contexto nos propusimos realizar un análisis genético-poblacional de la variación nucleotídica de los genes que mostraron un efecto mayor con respecto a los caracteres estudiados. Uno de ellos es Lipid storage droplet-2 (Lsd-2), el cual está vinculado a la regulación del transporte y almacenamiento de lípidos. En este trabajo, analizamos la secuencia completa del gen en 29 líneas isogénicas norteamericanas para las que contamos con la secuencia de todo el genoma. Además, estudiamos dos fragmentos del gen en dichas líneas y en isolíneas derivadas de cuatro poblaciones argentinas que constituyen los extremos de los gradientes geográficos (latitudinal y altitudinal) estudiados anteriormente. El análisis de la secuencia completa (4748 pb) reveló 31 sitios polimórficos (19 de ellos con variantes únicas ?singletons- y 12 con dos variantes presentes, cada una, en al menos dos alelos ?sitios informativos-). Tres de estos sitios segregantes se encuentran en la región codificante del gen y están asociados a sustituciones sinónimas. El análisis del fragmento del gen que incluye al exón 5 (538 pb, n = 47), reveló 10 sitios polimórficos (7 singletons y 3 informativos) de los cuales sólo uno está asociado a una sustitución sinónima. Por otro lado, el análisis del fragmento del gen que incluye al exón 4 (702 kb, n = 46), mostró 6 sitios polimórficos (2 singletons y 4 informativos) de los cuales dos están asociados a sustituciones sinónimas. Para este fragmento se observó un polimorfismo de inserción/deleción (indel) de 12 pb en la región no codificante en dos líneas derivadas de dos poblaciones diferentes (una de cada extremo del gradiente latitudinal). Para ambos fragmentos el número medio de sustituciones nucleotídicas por sitio entre poblaciones fue muy bajo. El análisis del ajuste de los patrones de variación a lo esperado según un modelo neutro mostró discrepancias significativas considerando distintos estadísticos genético-poblacionales (Dt, D*, F*, Fs, R2, etc.). Globalmente, los resultados muestran que Lsd-2 presenta escasa variación nucleotídica así como poca diferenciación entre poblaciones lo que sugiere que su función relacionada con el metabolismo lipídico se encuentra bastante conservada. Asimismo, los valores obtenidos para distintos estadísticos sugieren que las poblaciones de D. melanogaster han sufrido una expansión poblacional. Todos estos resultados son discutidos tomando en consideración la divergencia respecto de las secuencias de Lsd-2 de otras especies de Drosophila.