Examination of real-time PCR for HIV-1 RNA and DNA quantitation in patients infected with HIV-1 BF intersubtype recombinant variants.

SCHVACHSA N; TURK G,; BURGARD M,; DILERNIA D; CAROBENE M; PIPPO M; GOMEZ CARRILLO M,; ROUZIOUX C,; SALOMON H

JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS

ELSEVIER SCIENCE BV

Año: 2007 vol. 140 p. 222 - 227

0166-0934

El impacto de la diversidad genética del HIV-1 en el desarrollo de testeo de laboratorio es un tema que debiera ser monitoreado de manera constante. Se desarrolló un ensayo de Real-Time PCR para la cuantificación de carga viral propio de la Agence Nationale de Recherche sur le SIDA (ANRS) en Francia, basado en la amplificación de la región LTR del HIV-1. Esta tecnología no ha sido utilizada aún en Argentina y, considerando la diversidad del HIV-1 en el país, se llevó a cabo un análisis comparativo de este ensayo, versus el método Versant HIV-1 RNA 3.0 Assay (b-DNA). El desarrollo de la misma fue evaluado en 30 pacientes infectados por el HIV-1 vírgenes de tratamiento que fueron previamente caracterizados por análisis filogenético de los genes pol y vpu. Los resultados demostraron que existe una correlación lineal significativa entre los valores de los logaritmos de carga viral transformados de las muestras de pacientes infectados con el recombinante BF con la misma precisión y confiabilidad que con muestras de subtipo B. El uso del ensayo de Real-Time PCR interno para medir el DNA en PBMC estaba fuertemente asociado a los niveles del ARN del HIV-1 en todas las muestras.