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El deterioro fúngico de los alimentos, además de causar considerables pérdidas económicas, constituye un riesgo para la salud de los consumidores ya que un número importante de especies son productores de metabolitos tóxicos, las micotoxinas. El género Alternaria comprende numerosas especies tanto saprófitas como patógenas de plantas, muchas de las cuales son utilizadas como alimento. Algunas especies pueden producir micotoxinas en las plantas y en productos agrícolas, representando un riesgo para la salud humana y animal. El uso de conservantes químicos y pesticidas sintéticos para prevenir la contaminación fúngica de los alimentos causa la aparición de microorganismos resistentes, además de presentar alta toxicidad para los seres vivos y gran persistencia en el medio ambiente. Existe interés en la búsqueda de compuestos antifúngicos alternativos de menor toxicidad para utilizarlos en sistemas de conservación de alimentos. Numerosos estudios han demostrado que algunas plantas contienen compuestos de baja toxicidad capaces de inhibir el crecimiento microbiano. El objetivo de este trabajo fue investigar el efecto de diversos extractos de plantas sobre el crecimiento de cepas toxicogénicas de A.alternata y A.arborescens. En general los extractos de eucaliptus resultaron más inhibitorios que los de caléndula para ambas especies. La mayor inhibición del crecimiento para A. alternata se obtuvo con los extractos de cloroformo y metanol de eucaliptus (72,7 y 64,9% respectivamente), al igual que para A. arborescens (77,2% ambos extractos). Los extractos de caléndula más efectivos para ambas especies fueron el de metanol:agua y cloroformo. Los extractos evaluados resultaron efectivos para reducir la tasa de crecimiento de cepas de Alternaria spp. toxicogénicas. El uso de compuestos antifúngicos naturales es importante para la preservación de alimentos, control de contaminación de cultivos y prevención de riesgos para la salud humana y animal.