Caracterización bioinformática de cepas epidémicas de Virus Zika

LEIVA, S; ACOSTA, J; DIZANZO, P; BUGNON VALDANO, M; GARDIOL, D

Jornada; XIV Jornadas de Ciencias, Tecnologías e Innovación UNR; 2020

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El virus Zika (ZikV), es un virus de ARN del género de los Flavivirus. Desde su descubrimiento en 1947 se asoció sólo a infecciones asintomáticas o a cuadros febriles leves. Sin embargo, durante los últimos brotes en América, desde 2014, se identificaron nuevas características como el desarrollo de patologías del sistema nervioso, como microcefalia y el síndrome de Guillan-Barré. Sin embargo, una gran cantidad de infecciones por ZikV durante dichos brotes no desarrollaron condiciones clínicas severas. Estas observaciones sugieren un cambio en la biología y epidemiología de las cepas epidémicas de ZikV en comparación con las cepas pre-epidémicas y una aparente heterogeneidad dentro de las cepas epidémicas. Estas diferencias podrían deberse a alteraciones genómicas que algunas de ellas habrían adquirido en el tiempo. En este contexto, desarrollamos un enfoque visual e intuitivo para organizar conjuntos de datos de secuencias genómicas de ZikV con el fin de identificar genes con diferentes niveles de variabilidad y buscar patrones de variaciones genómicas que podrían asociarse con las diferencias reportadas entre las cepas de ZikV.Así, las cepas de la mayoría de los casos durante los brotes se compararon con las cepas epidémicas responsables de enfermedades graves y con las cepas no asociadas a brotes (pre-epidémicas) para detectar variaciones genómicas. La información asociada con las variaciones nucleotídicas detectadas durante estas comparaciones, como sus coordenadas genómicas, sus consecuencias translacionales y su frecuencia dentro de los diferentes grupos de ZikV, se recopiló para crear una base de datos multidimensional. Con dicha base se analizó con diferentes enfoques las posibles relaciones entre la variabilidad y las diferencias biológicas y epidemiológicas reportadas entre estos grupos de cepas de ZikV. Detectamos genes con diferentes niveles de variabilidad y generamos un registro de variantes nucleotídicas no sinónimas que podrían asociarse a las diferencias reportadas para los distintos grupos de cepas de ZikV.