IBR   13079
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR DE ROSARIO
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Metodología de fusión de datos aplicada en análisis metabolómicos no-dirigidos asistidos por quimiometría
Autor/es:
ROMÀ TAULER; ALEJANDRO G. GARCÍA REIRIZ; FRANCESC PUIG CASTELLVÍ; PAULA BURDISSO; ANDRÉS MARTÍNEZ BILESIO; RODOLFO RASIA
Lugar:
Santa Rosa
Reunión:
Congreso; X Congreso Argentino de Química Analítica; 2019
Institución organizadora:
AAQA
Resumen:
En este trabajo se presenta una novedosa metodología de análisis metabolómico utilizando datos provenientes de 150 voluntarios sanos de la región centro de la República Argentina. Se dispuso de la metadata clínica, que incluía parámetros cualitativos y determinaciones bioquímicas cuantitativas, y de los perfiles metabólicos de distintos biofluidos (suero y orina) obtenidos mediante resonancia magnética nuclear (RMN)1. Los datos generados para cada uno de los individuos se fusionaron en una única ?matriz global? a través de herramientas quimiométricas, con el propósito de realizar su análisis conjunto.Para una adecuada fusión de los datos, los espectros adquiridos por RMN sobre las muestras de suero y orina debieron ser pre-procesados siguiendo distintos esquemas según el tipo de biofluido. Los espectros correspondientes a las muestras de suero se alinearon empleando el algoritmo icoshift2, mientras que para alinear los espectros de las muestras de orina se utilizó el algoritmo Speaq3. El empleo de distintos algoritmos según el tipo de biofluido se fundamenta en que la estrategia propuesta para muestras de suero no logra resolver apropiadamente los inconvenientes de alineación observados en los espectros de las muestras de orina, los cuales resultan considerablemente más complejos.A continuación, cada set de espectros fue normalizado por separado empleando Probabilistic Quantum Normalization (PQN)4. Posteriormente, la cuantificación de los metabolitos en las muestras de suero se realizó a través de la deconvolución espectral utilizando el software BATMAN5. Por otro lado, la cuantificación de los metabolitos en las muestras de orina se efectuó por una metodología de Decision Tree Correlation (DTC) seguida de la descomposición bilineal por Multivariate Curve Resolution - Alternating Least Square (MCR-ALS)6.De esta manera, se logró obtener un conjunto de concentraciones relativas para los metabolitos más representativos en las muestras de suero y orina, que luego se fusionaron con los valores provenientes de la metadata, obteniendo de este modo la ?matriz global? de datos antes mencionada.En una última etapa se realizó el análisis de componentes principales (PCA), que permitió detectar aquellos componentes que reúnen las principales contribuciones a la varianza de los datos. Adicionalmente, la ?matriz global? también se analizó por MCR-ALS, evidenciándose la relación de los distintos metabolitos con la metada y su distribución entre las distintas muestras.