Análisis de genómica comparativa muestran un clado de cepas portadoras de genes con implicancia clínica en la especie ambiental A. bereziniae

BROVEDAN M; ESPARIZ M.; REPIZO GD; VIALE AM; MARCHIARO P; LIMANSKY A

Rosario

Jornada; JAM2018; 2018

p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; }p.western { font-family: "Calibri",sans-serif; font-size: 11pt; }p.cjk { font-family: "Calibri",sans-serif; font-size: 11pt; }p.ctl { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 11pt; }a:link { color: rgb(0, 0, 255); }a.ctl:link { font-family: "Times New Roman",serif; }Acinetobacterbereziniae (Abe),especie ambiental poco asociadaa infecciones nosocomiales, exhibeactualmente cepas resistentes a carbapenemes (1). Reportamosrecientemente el genoma de una cepa local portadora de blaNDM-1(1 y 2), siendo 7 los depositados al presente. Evaluamos lavariabilidad genética intraespecífica, y la presencia de cepas quecomparten características adaptativas. Incluimos en este estudioestos 7 genomas y2 Acinetobactersp(Ag2 y WC-743) identificados aquí como Abemediante "Average Nucleotide Identity" (3). Elempleo de"Pan-Genomes Analysis Pipeline" (PGAP) nos permitióconocer que70% de losgenes de Abepertenecen al "core?(n= 3014), mientras que 30% restante (n= ~ 1200) es accesorio.Similaranálisis conA.baumannii (Aba,4), mostró 1590 genes "core", constituyendo 40% del total.La comparación del pangenomade Abey Abamostró7508 y 9513 genes, respectivamente. Estos resultados muestran que Abees una especie de baja plasticidad. El análisis filogenético basadoen las secuencias concatenadas de 1663 genes del genoma ?core? delas cepas de Abeincluyendocepas tipo de A.gerneri yA.guillouiae,distinguió 4 grupos: i) NIPH3;ii) XH901; iii) CIP 70.12 y KCTC 23199 y iv) HPC229, CHI-40-1,507_ABAU, WC-743 y Ag2. Laevaluación de cepas que comparten características funcionalesempleandoOrthoMCL (2) mostró3 grupos:i)CIP 70.12 y KCTC23199 (aisladas en 1960); ii) NIPH 3 (1991) y iii) 507_ABAU, WC-743,Ag2, CHI-40-1, HPC229 y XH901 (desde 2005). El repertorio proteicomostró ausencia/presencia de genes codificantes de mecanismos deresistencia, factores de virulencia y transposones, en grupos i-ii,respecto de iii, respectivamente. Estetrabajo aporta así evidencias de la capacidad de ciertas cepas deAbedeadaptarse a hábitats nosocomiales, explicando el hallazgo de estaespecie en especímenes clínicos.1-Brovedanetal,AAC, 20152-Brovedanetal,Gen Announc, 20163-Espariz etal,PLoS ONE, 20164-Touchon etal, Gen Biol Evol,2014