Búsqueda computacional de inhibidores de la enolasa de Trypanosoma cruzi

MARIANA R. MIRANDA; CLAUDIO A. PEREIRA; EDWARD A. VALERA VERA; MELISA SAYÉ; CHANTAL REIGADA

Buenos Aires

Simposio; XIX Simposio Internacional sobre Enfermedades Desatendidas; 2019

Fundación Mundo Sano

La enolasa de trypanosomatidos ha sido señalada como posible blanco terapéutico por su papel en el metabolismo de azúcares, en procesos de diferenciación, y su capacidad de unión a plasminógeno por la que podría constituir un factorde virulencia, además de poseer una sustitución aminoacídica en el sitio activo que la diferencia de sus homólogos en humanos. Se ha determinado experimentalmente la interacción de algunas moléculas con el sitio activo de la enzima, información que se puede usar en la descripción del modo de interacción y la búsqueda de nuevos inhibidores de la enolasa de T. cruzi (TcENO) mediante el uso de herramientas computacionales. Empleando 5 distintos algoritmos desimilitud se hizo una búsqueda computacional en la base de datos Sweetlead de compuestos medicinales para encontrar análogos a 4 ligandos conocidos de la enolasa con potencial de interactuar con el sitio activo de la TcENO. Loscompuestos clasificados entre los 10 más similares por al menos 3 de los algoritmos usados se seleccionaron para ensayos de acoplado molecular, usando como receptor un modelo por hmología de la TcENO. Las poses producidas se reevaluaron con NNScore, que puntúa con mayor precisión las poses obtenidas del acoplamiento. Las poses de los compuestos puntuados como ?buenos ligandos? seusaron en simulaciones de dinámica molecular de 50ns a fin de caracterizar la estabilidad y el modo de las interacciones predichas, comparándolas con dinámicas producidas para la enzima sin ligando, y en complejo con su ligando natural, el PEP. De la búsqueda por similitud se obtuvieron 6 compuestos de uso medicinal que cumplieron con el criterio de selección (etidronato, pamidronato, fosfomicina, acetohidroxamato, triclofos, y aminohidroxibutirato). En los ensayos de acoplado molecular el acetohidroxamato y el triclofos no interactuaban con el sitio activo de la enzima, mientras NNScore puntuó a fosfomicina y aminohidroxibutiraro como ?malos ligandos? de la enzima. En las simulaciones de dinámica molecular se observó que el pamidronato perdía lasinteracciones predichas en el acoplamiento molecular, con una energía de unión cercana a cero y migración dentro del sitio activo de la enzima; mientras que el etidronato mantuvo la misma conformación, con energías favorables, y dándole a la enzima una mayor estabilidad comparable con la que brinda la unión del PEP. En este contexto, los modelos computacionales empleados destacan al etidronato como potencial ligando de la TcENO.