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STAT3 es un factor de transcripción nuclear que media la respuesta de citoquinas de fase aguda y otras hormonas contribuyendo al desarrollo de insulino resistencia. Recientemente se descubrió un nuevo papel del STAT3 como regulador de la función mitocondrial. También es sabido que el número de copias de ADN mitocondrial (ADNm) se relaciona con la función mitocondrial, y que distintos factores nucleares intervienen en este proceso, aunque hasta ahora se desconoce si el STAT3 está involucrado en esta función. El objetivo de nuestro trabajo fue estudiar la posible asociación entre el contenido de ADNm y polimorfismos de nucleótido único (SNPs) del gen STAT3. Se incluyeron en un estudio de sección transversal 108 pacientes con características del síndrome metabólico y 55 controles; el protocolo fue aprobado por el comité de ética de la Institución. Del proyecto HapMap se seleccionaron 3 tagSNPs con una frecuencia del alelo menor >10% (rs2293152, C/G, rs6503695, C/T y rs9891119 A/C) los que representan 24 sitios polimórficos del gen STAT3 (r2>0.8), y comprenden una región de 68.6Kb del cromosoma 17. A partir del ADN extraído de leucocitos de sangre periférica se genotipificaron los SNPs mediante PCR alelo especifica y se determinó el contenido de ADNm a través de la relación ADNm / ADN nuclear (Rel) utilizando PCR en tiempo real. Los SNPs se encontraron en Equilibrio de Hardy Weinberg. Los genotipos del rs9891119 se asociaron con el log Rel ajustada por HOMA: AA 1.58±0.06; AC 1.34±0.09, y CC 1.15±0.16 (media±ES, ANCOVA, p<0.02). Los restantes SNPs no se asociaron con la Rel, aunque se observó una tendencia de asociación con el rs6503695 (p=0.06). En conclusión, mostramos por primera vez que variantes comunes del STAT3 podrían tener un rol en el mantenimiento y/o regulación del contenido del ADNm y por lo tanto contribuir a la variabilidad genética en la regulación de la función mitocondrial.