ANÁLISIS GENÓMICO DE LA RIZOBACTERIA BURKHOLDERIA AMBIFARIA T16 CON CAPACIDAD DE DEGRADAR ACIDO FUSÁRICO

DRAGHI, WALTER; SIMONETTI, ESTER; RUIZ, JIMENA ALICIA; ALVAREZ, FLORENCIA; VINACOUR, MATIAS

CABA

Congreso; XII Reunión Anual Científico-Técnica de Biología de Suelos.; 2019

Cátedra de Microbiología. Facultad de Agronomía. FAUBA.

Las especies del género Burkholderia se caracterizan por presentar genomas de gran tamaño (7 a 9 Mb) y una gran versatilidad metabólica. Sus genomas albergan clusters génicos (BGC) destinados a la biosíntesis de metabolitos secundarios que favorecen la colonización de diferentes nichos ecológicos incluida la rizósfera. En el presente trabajo se llevó a cabo un análisis genómico de la cepa Burkholderia ambifaria T16. Esta cepa mostró la capacidad de degradar ácido fusárico (AF) así como también de inhibir in vitro el crecimiento de varias especies de Fusarium. La secuenciación genómica se realizó mediante la tecnología Illumina HiSeq resultando en lecturas paired-end de 101X de cobertura que fueron ensambladas de novo en 55 scaffolds (N50 267.361 bp; L50 10) utilizando el software ABySS. El genoma de 7,4 Mb presenta un contenido de GC de 66,1% y 6770 secuencias codificantes agrupadas en 530 subsistemas de acuerdo al servidor RAST. Se detectaron BGC de péptidos no ribosomales y policétidos, muchos de los cuales están asociados a la actividad antimicrobiana. Además se identificaron genes implicados en la promoción del crecimiento vegetal, en la tolerancia/resistencia a estrés y en la capacidad de degradar compuestos aromáticos. Resultados preliminares obtenidos por genómica comparativa podrían asociar la presencia de determinados genes de oxigenasas con el fenotipo de degradación de AF.