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Una de las plagas más comunes de la soja (Glycine max) son las chinches Piezodorus guildinii y Nezara viridula, que se alimentan de las semillas en formación, produciendo pérdidas de rendimiento. Las plantas responden al ataque de insectos produciendo defensas químicas reguladas por el acido jasmonico (AJ), como los isoflavonoides e inhibidores de proteasas (IP) que afectan el crecimiento de los insectos. Sorprendentemente, hasta el momento se desconoce el mecanismo de las defensas inducidas de semillas en formación. El objetivo del presente trabajo fue determinar si el AJ regula la síntesis de las defensas químicas IP e isflavonoides, como daidzeína, genisteína y sus glicósidos, en semillas de soja en formación. Se utilizó un cultivar de soja Williams y el mutante BRM que no acumula AJ en las semillas. Los tratamientos de ataque de chinches, aplicación de MeAJ y daño mecánico indujeron los genes lox 1, 2 y 3 en el cv Williams, pero no hubo cambios en la expresión de los genes lox en el mutante BRM, a pesar de los tratamientos. Tanto los niveles constitutivos, como los inducibles de los isoflavonoides daidzeína, genisteína y sus glicósidos daidzina y genistina, y los IP en las semillas del mutante BRM fueron menores que en las semillas del cv Williams. Nuestros resultados mostraron una clara conexión entre la expresión de los genes lox en semillas y las defensas inducidas.