Variantes de splicing lineales y circulares de Smaug1/Samd4a durante la diferenciación adipocítica

FERNÁNDEZ ALVAREZ, ANA JULIA; ARIZACA MAQUEDA, KAROL; PIMENTEL, JERÓNIMO; BOCCACCIO, GRACIELA L

Buenos Aires

Workshop; Workshop de Biologia Celular y Molecular del ARN; 2018

Club del RNA de Buenos Aires

El gen murino del represor traduccional Smaug1/Samd4a contiene 13 exones, siendo el exón IV de la especie Mus Musculus (exón III de Homo sapiens) de uso alternativo. Estas isoformas se expresan diferencialmente durante el desarrollo de neuronas y forman cuerpos citosólicos cuando se transfectan en líneas celulares. La isoforma que carece del exón III /IV, une y reprime RNA de manera comparable a la proteína completa (Fernandez Alvarez et al 2016). Además, RNA circulares de Smaug1 que corresponden al exón II en humanos y al exón III en ratón (hsa_circ_0004846 y mmu_circ_0000529, respectivamente) se expresan en cerebro. Aquí investigamos el patrón de splicing de Smaug1/Samd4a durante la diferenciación adipocítica empleando PCR en tiempo real con primers específicos para cada una de las variantes lineales y circulares. Encontramos que mmu_circ_0000529 se expresa en tejido adiposo y en adipocitos 3T3L1. La identidad de la forma circular fue corroborada por secuenciación del producto de PCR. Durante la diferenciación de adipocitos 3T3L1 las tres isoformas aumentan más o menos simultáneamente. Las variantes lineales generan los polipéptidos correspondientes. Desconocemos la relevancia funcional de los circRNA de Smaug1.