The relationship between the regulation of alternative exons in response to DNA damage and the architecture of the flanking introns.

PREGO A; MUÑOZ MJ; SCHOR IE

Buenos Aires

Workshop; Workshop Biología Celular y Molecular del ARN; 2018

El daño en elDNA afecta los patrones de expresión génica por diferentes mecanismos. Estosincluyen expresión diferencial de genes y también el cambio entre isoformas deun mismo gen por medio de la regulación del splicing alternativo (AS). Entrabajos previos (Muñoz et al, 2017) se caracterizó una vía que modula lospatrones de AS en queratinocitos humanos tratadas con UV, que incluye lageneración de dímeros de pirimidina, la quinasa ATR y la fosforilación de laRNA polimerasa II, un importante mediador de la respuesta. A partir de unexperimento de RNA-seq analizando el efecto del daño al DNA y su reparación,encontramos que la respuesta de los exones alternativos al daño es afectada porla longitud de los intrones flanqueantes, sugiriendo dos mecanismosalternativos: intrones flanqueantes más largos favorecen la exclusión del exóndel mRNA maduro; mientras que intrones más cortos río arriba por el contrario favorecenmayor inclusión, lo cual puede estar relacionado a cambios en la tasa deelongación de RNA pol II (Muñoz et al 2009, 2017). Para corroborar que el dañoal DNA causa cambios en la tasa de elongación en este grupo de genes, seseleccionaron exones con intrones río arriba cortos y se analizó la velocidadde la RNA pol II utilizando un método bioqúimico (Singh & Padgett, 2009).Este trabajo propone mecanismos regulatorios de relevancia en la respuesta adaño genotóxico, a partir del análisis genómico combinado con validaciónexperimental.