Caracterización estructural y funcional del espaciador intergénico (IGS) del rDNA 25S-18S en el ají cultivado Capsicum pubescens (Solanaceae)

GRABIELE, M.; DEBAT, H. J.; MOSCONE, E. A.; DUCASSE, D. A.

Tandil, Buenos Aires

Congreso; XXXVII Congreso Argentino de Genética.; 2008

Sociedad Argentina de Genética

Se determinó la estructura primaria del espaciador intergénico (IGS) del rDNA25S-18S en el ají cultivado Capsicum pubescens. El IGS (2077pb; 48,8% GC) muestra 7 regiones estructurales (SRI-VII). SRI (393pb) tiene un bloque típico de pirimidinas (CCCTCCCCCTTCAATCC, 17pb), 3 copias (GAGGTTT/GAGGTTTT/GAGGCTTTT) similares al motivo GAGGTTTTT, probable sitio de terminación de la transcripción (TTS) en Solanaceae y el motivo CTTTT, que se presume señal de procesamiento del extremo-3´ del rRNA 25S. En el extremo-3´ de SRI, se encontró una región de 21pb idéntica al rRNA 18S, con implicancias a nivel regulatorio post-transcripcional. SRII (Ncol-box; 375pb; 60,21% GC) está formada por 47 repeticiones similares a los motivos mas abundantes CACCATGG/CACCAAGG. SRIII (309pb; 72,2%AT)precedea SRIV(73pb;64,5%AT), altamente conservada en Solanaceae y posee un bloque de poli-T (1Opb)Yel sitio de iniciaciónde la transcripción (TIS) TATATAAGAGGGG. En SRV(131pb) encontramos un "stem-loop" de 80pb de gran estabilidad (~G=-42.60), altamente conservado en especies afines, que en base a análisis bioinformáticos, proponemos como un miRNA aun no descrito que estaría implicado en la regulación interna del rDNA 45S en Solanaceae. SRVI(220pb) muestra una repetición inversa; por su estructura secundaria sería un sitio de unión a factores de transcripción. Finalmente, SRVII (576pb) está altamente conservada en la familia. La región transcripta del IGS (ETS) posee 958pb. Se encontró variabilidad intraespecífica en el IGS. Los datos se discuten con previos en Solanaceae