Análisis de la estructura primaria y secundaria de la molécula de rRNA 5S en Capsicum (Solanaceae)

DEBAT, H. J.; GRABIELE, M.; MOSCONE, E. A.; DUCASSE, D. A.

Pergamino (Argentina)

Congreso; XXXVI Congreso Argentino de Genética; 2007

Sociedad Argentina de Genética

Las estructuras primaria y secundaria del rRNA 5S se consideran altamente conservadas en eucariotas, pero la información sobre su secuencia, organización y variación en plantas superiores es limitada. En este trabajo se analiza la secuencia y estructura del rDNA 5S mediante clonado y secuenciación de múltiples copias en 15 representantes de Capsicum. Los resultados revelan variaciones tanto en la estructura primaria como secundaria entre copias del gen y su producto a nivel de individuos y especies. La región codificante del rDNA 5S tiene una longitud de ca. 120pb en los 37 clones secuenciados, con una identidad aproximada al 95% dentro del género. Se dedujo la estructura secundaria del rRNA 5S de Capsicum, que consiste en cinco hélices, dos bucles en hebilla, dos bucles internos y uno en bisagra que forma la unión de tres hélices, con variaciones que afectarían esta estructura. Se encontraron 54% de sitios variables y 134 mutaciones (82% en regiones hélice), el 60% son transiciones o mutaciones múltiples compensatorias que mantienen estable la estructura secundaria. Un 63% de las mutaciones afectan regiones de unión a factores de transcripción y sitios de unión al DNA imprescindibles para la expresión y funcionalidad de la molécula. Del total de clones secuenciados se especulan unos 24 genes funcionales. Los datos aportados se consideran valiosos para el conocimiento de la estructura genómica en el género.