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La fragmentación del hábitat puede afectar la riqueza y estructura de las comunidades. Se espera que las especies al final de las cadenas tróficas, especialistas y raras muestren los efectos más pronunciados. Dado que las especies se encuentran inmersas en intrincadas redes de interacción, efectos diferenciales de la fragmentación sobre determinados grupos de especies podrían alterar la organización de dichas redes. A fin de evaluar esta hipótesis, construimos redes tróficas cuantitativas de plantas, minadores de hoja y parasitoides correspondientes a 19 fragmentos de Bosque Serrano, conformando un gradiente de tamaño. La pérdida de hábitat afectó negativamente a la riqueza de especies en el sistema, con especial énfasis para las especies raras pero independientemente de su posición trófica o grado de especialización. La estructura de las redes resultó afectada, especialmente al considerar aspectos cualitativos. A medida que se redujo el área de bosque las redes presentaron menor proporción de parasitoides, menor densidad de interacciones y mayor conectancia. Al mismo tiempo, disminuyó la intensidad de los procesos tróficos asociados a estas comunidades. La fragmentación del bosque modificó la estructura comunitaria afectando no sólo la riqueza y composición sino también la organización de las redes tróficas y, finalmente, el funcionamiento del sistema.