ARNs largos no codificantes en espigas afectadas por fusariosis en Triticum turgidum ssp. durum

DÍAZ, MARINA L.; CRISTIAN GALLO; DANIELA SORESI; SANDRA MICHELETTO; ALICIA CARRERA

Buenos Aires Virtual

Congreso; XLVIII Congreso Argentina de Genética; 2020

Sociedad Argentina de Genética y Comisión local

Los ARN largos no codificantes (ARNlnc) sontranscriptos no codificantes (> a 200 nt.) involucradosen la regulación de la expresión génica a distintosniveles. Nuestro objetivo es caracterizar los ARNlncobtenidos de dos genotecas de ADNc de espigas de trigocandeal inoculadas con Fusarium graminearum de lavariedad susceptible Langdon y de la línea resistenteLangdon(Dic-3A)10, a 72 hs post-inoculación. Laslecturas generadas por tecnología Illumina fueronmapeadas en el genoma de referencia de trigo candeal,cv. Svevo, que cuenta con anotación disponible.Además, se utilizaron las herramientas CPC (CodingPotential Calculator) y AUGUSTUS como predictores deARNnc y MiRBase para precursores de microARNs. Entotal se identificaron 76.296 genes expresados, de loscuales 921 fueron diferenciales entre genotipos (FDR≤0,05; logFC ≥|2|); se encontraron 1530 ARNlnc y 22de ellos mostraron expresión diferencial (FDR ≤0,05;logFC ≥|2|), 10 estaban inducidos en el genotiporesistente y 12 en el susceptible. La longitud promediofue de 277 nucleótidos y se distribuyeron en todoslos cromosomas excepto en 3B, 6A y 7B. Se observóque el 81% se localizó en regiones intergénicas,mientras que los restantes resultaron intrónicos (2antisentido y 2 sentido). Dos ARNlnc intergénicosresultaron precursores de microARNs. Continuamoscon la identificación de los mecanismos de regulaciónen los que intervienen y sus genes target. Los RNAlnccon expresión diferencial identificados podrían serreguladores potencialmente responsables de lasdiferencias en resistencia a Fusarium entre Langdon yLangdon(Dic-3A)