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El uso continuado de los suelos con prolongación de los ciclos agrícolas, la utilización de labranzas y la inclusión de cultivos estivales, hace necesario determinar el grado de estabilidad del carbono orgánico (CO) acumulado y de las fracciones con diferente grado de labilidad. El ensayo de larga duración fue conducido en la Chacra Experimental Integrada Barrow, donde se evaluaron cinco secuencias de cultivos, alternando leguminosas, oleaginosas y gramíneas, con dosis de N y labranza convencional. Los objetivos fueron: i) determinar el efecto de la rotación de cultivos y de la fertilización sobre las fracciones orgánicas de C, ii) medir el Índice de Recalcitrancia (IR) de estas fracciones, iii) evaluar la labilidad del C a través de las relaciones entre las diferentes fracciones de C y iv) establecer la relación entre la fracción lábil de C y la capacidad de aportar N. Se usó la técnica de la hidrólisis ácida para separar las fracciones lábiles y recalcitrantes y medir el IR. Los distintos cultivos aportaron diferentes cantidades de residuos al suelo ocasionando que cada sistema se comporte diferente a la aplicación de N con niveles semejantes de CO. Las secuencias con leguminosas y gramíneas, maíz-trigo, presentaron los mayores porcentajes de la fracción más lábil de C (carbono orgánico particulado fino, COPf), con 20% de labilidad respecto a las fracciones no lábiles (más recalcitrantes). Los cultivos de verano en la rotación (soja-trigo), cuyos residuos presentaron menores relaciones C:N, y donde la mineralización del C no sería compensada con el mayor aporte de residuos, podría asociarse a una mayor suceptibilidad a la degradación química. El N potencialmente mineralizable incubado anaeróbicamente (NAN), se asoció a la porción de C lábil más abundante en el suelo. La fertilización nitrogenada, asociada al C lábil del suelo, aportaría N potencialmente mineralizable al sistema y disponible para el cultivo.