CERZOS 05458
CENTRO DE RECURSOS NATURALES RENOVABLES DE LA ZONA SEMIARIDA
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Identificación de genes relacionados a calidad del forraje y al modo reproductivo en pasto llorón
Autor/es:
ECHENIQUE, V.
Lugar:
San Luis
Reunión:
Taller; Reunión Argentina de Producción Animal; 2008
Resumen:
El pasto llorón (Eragrostis curvula) es una gramínea de regiones tropicales y subtropicales, que
en Argentina, cubre una superficie de cerca de 800.000 has. Sin embargo, la región
potencialmente cultivable con la misma es mayor, ya que tiene la capacidad de colonizar
regiones marginales de producción debido a sus bajos requerimientos de riego y fertilización,
su rápido crecimiento y su gran producción de biomasa en suelos pobres y ambientes
semidesérticos. Desde hace varios años nuestro grupo de trabajo se encuentra enfocado en la
aplicación de herramientas de biotecnología para el mejoramiento del pasto llorón. Para ello se
han aplicado diferentes técnicas que van desde el cultivo de tejidos y transformación genética
hasta herramientas de genómica y transcriptómica. Entre ellas se incluyen: la generación de una
serie euploide (diploide sexual, tetraploide con alto grado de sexualidad y tetraploide apomíctico)
muy útil para el estudio de los cambios genéticos y epigenéticos relacionados con cambios en
los niveles de ploidía y la forma de reproducción, la generación de una técnica de deposición
de calosa empleada con el fin de diferenciar plantas sexuales y apomícticas eficientemente en
los tests de progenie, la generación de bibliotecas de cDNA para estudios de mapeo genómico
y análisis del transcriptoma; y el uso de marcadores moleculares para la identificación de
cultivares y de aquellos genes relacionados con la ploidía y la apomixis. De nuestras bibliotecas
de cDNA, se ensamblaron 12.300 ESTs, se identificaron 8.864 unigenes y se asignaron roles
funcionales al 80% de los mismos. Los estudios de RAPDs y AFLPs de la serie mostraron que
el 32% de los polimorfismos detectados estaban relacionados con cambios en los niveles de
ploidía y/o modo reproductivo. Análisis de agrupamiento mostraron que ambos tetraploides
estaban más estrechamente relacionados entre sí que con el diploide. Además, las
comparaciones entre los grupos de diferentes ploidía y modos reproductivos en los estudios de
expresión diferencial indicaron que un bajo porcentaje de los genes se encuentran regulados
negativamente en los diploides sexuales y los tetraploides apomícticos y sobreexpresados en
los tetraploides sexuales, sugiriendo que la diplosporía puede ser una falla en la expresión de
la sexualidad en los poliploides. Entre las secuencias encontradas se incluyen genes
involucrados en el ciclo celular, la síntesis y degradación de proteínas, la síntesis de ARN y
ADN, elementos repetitivos, proteínas ribosomales, factores de transcripción, factores de
elongación y proteínas que se expresan en situaciones de estrés. Además, se identificaron
secuencias relacionadas con la biosíntesis de lignina como el gen de la enzima CCoAOMT y dos
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
muy útil para el estudio de los cambios genéticos y epigenéticos relacionados con cambios en
los niveles de ploidía y la forma de reproducción, la generación de una técnica de deposición
de calosa empleada con el fin de diferenciar plantas sexuales y apomícticas eficientemente en
los tests de progenie, la generación de bibliotecas de cDNA para estudios de mapeo genómico
y análisis del transcriptoma; y el uso de marcadores moleculares para la identificación de
cultivares y de aquellos genes relacionados con la ploidía y la apomixis. De nuestras bibliotecas
de cDNA, se ensamblaron 12.300 ESTs, se identificaron 8.864 unigenes y se asignaron roles
funcionales al 80% de los mismos. Los estudios de RAPDs y AFLPs de la serie mostraron que
el 32% de los polimorfismos detectados estaban relacionados con cambios en los niveles de
ploidía y/o modo reproductivo. Análisis de agrupamiento mostraron que ambos tetraploides
estaban más estrechamente relacionados entre sí que con el diploide. Además, las
comparaciones entre los grupos de diferentes ploidía y modos reproductivos en los estudios de
expresión diferencial indicaron que un bajo porcentaje de los genes se encuentran regulados
negativamente en los diploides sexuales y los tetraploides apomícticos y sobreexpresados en
los tetraploides sexuales, sugiriendo que la diplosporía puede ser una falla en la expresión de
la sexualidad en los poliploides. Entre las secuencias encontradas se incluyen genes
involucrados en el ciclo celular, la síntesis y degradación de proteínas, la síntesis de ARN y
ADN, elementos repetitivos, proteínas ribosomales, factores de transcripción, factores de
elongación y proteínas que se expresan en situaciones de estrés. Además, se identificaron
secuencias relacionadas con la biosíntesis de lignina como el gen de la enzima CCoAOMT y dos
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
Palabras clave: pasto llorón, Eragrostis curvula, mejoramiento molecular, genómica,
biotecnología.pasto llorón, Eragrostis curvula, mejoramiento molecular, genómica,
biotecnología.Eragrostis curvula) es una gramínea de regiones tropicales y subtropicales, que
en Argentina, cubre una superficie de cerca de 800.000 has. Sin embargo, la región
potencialmente cultivable con la misma es mayor, ya que tiene la capacidad de colonizar
regiones marginales de producción debido a sus bajos requerimientos de riego y fertilización,
su rápido crecimiento y su gran producción de biomasa en suelos pobres y ambientes
semidesérticos. Desde hace varios años nuestro grupo de trabajo se encuentra enfocado en la
aplicación de herramientas de biotecnología para el mejoramiento del pasto llorón. Para ello se
han aplicado diferentes técnicas que van desde el cultivo de tejidos y transformación genética
hasta herramientas de genómica y transcriptómica. Entre ellas se incluyen: la generación de una
serie euploide (diploide sexual, tetraploide con alto grado de sexualidad y tetraploide apomíctico)
muy útil para el estudio de los cambios genéticos y epigenéticos relacionados con cambios en
los niveles de ploidía y la forma de reproducción, la generación de una técnica de deposición
de calosa empleada con el fin de diferenciar plantas sexuales y apomícticas eficientemente en
los tests de progenie, la generación de bibliotecas de cDNA para estudios de mapeo genómico
y análisis del transcriptoma; y el uso de marcadores moleculares para la identificación de
cultivares y de aquellos genes relacionados con la ploidía y la apomixis. De nuestras bibliotecas
de cDNA, se ensamblaron 12.300 ESTs, se identificaron 8.864 unigenes y se asignaron roles
funcionales al 80% de los mismos. Los estudios de RAPDs y AFLPs de la serie mostraron que
el 32% de los polimorfismos detectados estaban relacionados con cambios en los niveles de
ploidía y/o modo reproductivo. Análisis de agrupamiento mostraron que ambos tetraploides
estaban más estrechamente relacionados entre sí que con el diploide. Además, las
comparaciones entre los grupos de diferentes ploidía y modos reproductivos en los estudios de
expresión diferencial indicaron que un bajo porcentaje de los genes se encuentran regulados
negativamente en los diploides sexuales y los tetraploides apomícticos y sobreexpresados en
los tetraploides sexuales, sugiriendo que la diplosporía puede ser una falla en la expresión de
la sexualidad en los poliploides. Entre las secuencias encontradas se incluyen genes
involucrados en el ciclo celular, la síntesis y degradación de proteínas, la síntesis de ARN y
ADN, elementos repetitivos, proteínas ribosomales, factores de transcripción, factores de
elongación y proteínas que se expresan en situaciones de estrés. Además, se identificaron
secuencias relacionadas con la biosíntesis de lignina como el gen de la enzima CCoAOMT y dos
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
muy útil para el estudio de los cambios genéticos y epigenéticos relacionados con cambios en
los niveles de ploidía y la forma de reproducción, la generación de una técnica de deposición
de calosa empleada con el fin de diferenciar plantas sexuales y apomícticas eficientemente en
los tests de progenie, la generación de bibliotecas de cDNA para estudios de mapeo genómico
y análisis del transcriptoma; y el uso de marcadores moleculares para la identificación de
cultivares y de aquellos genes relacionados con la ploidía y la apomixis. De nuestras bibliotecas
de cDNA, se ensamblaron 12.300 ESTs, se identificaron 8.864 unigenes y se asignaron roles
funcionales al 80% de los mismos. Los estudios de RAPDs y AFLPs de la serie mostraron que
el 32% de los polimorfismos detectados estaban relacionados con cambios en los niveles de
ploidía y/o modo reproductivo. Análisis de agrupamiento mostraron que ambos tetraploides
estaban más estrechamente relacionados entre sí que con el diploide. Además, las
comparaciones entre los grupos de diferentes ploidía y modos reproductivos en los estudios de
expresión diferencial indicaron que un bajo porcentaje de los genes se encuentran regulados
negativamente en los diploides sexuales y los tetraploides apomícticos y sobreexpresados en
los tetraploides sexuales, sugiriendo que la diplosporía puede ser una falla en la expresión de
la sexualidad en los poliploides. Entre las secuencias encontradas se incluyen genes
involucrados en el ciclo celular, la síntesis y degradación de proteínas, la síntesis de ARN y
ADN, elementos repetitivos, proteínas ribosomales, factores de transcripción, factores de
elongación y proteínas que se expresan en situaciones de estrés. Además, se identificaron
secuencias relacionadas con la biosíntesis de lignina como el gen de la enzima CCoAOMT y dos
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
factores de transcripción del tipo R2R3MYB. Estas secuencias son candidatas interesantes para
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
mejorar la calidad forrajera del pasto llorón por transgénesis. Nuestro laboratorio está
desarrollando protocolos de regeneración, selección y transformación para poder evaluar el rol
de estos genes relacionados con la apomixis y la síntesis de lignina en plantas transgénicas de
pasto llorón. Por otro lado, los recursos generados serán utilizados para la implementación de
tecnologías moleculares usando marcadores moleculares, ya que a partir de las genotecas se
han identificado 254 SSRs y 190 SNPs/indels. Estos se usarán en poblaciones de mapeo a nivel
tetraploide, obtenidas de la serie generada y que segreguen por modo reproductivo o calidad
de forraje. Se registraron además tres materiales obtenidos por variación somaclonal.
Palabras clave: pasto llorón, Eragrostis curvula, mejoramiento molecular, genómica,
biotecnología.pasto llorón, Eragrostis curvula, mejoramiento molecular, genómica,
biotecnología.
