ANÁLISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE TRIGO CANDEAL PARA LA IDENTIFICACIÓN DE GENES DE RESPUESTA A BAJAS TEMPERATURAS

CUPPARI SELVA; BASUALDO JESSICA; REVALE SANTIAGO; SORESI DANIELA; CARRERA ALICIA; DÍAZ MARINA

Mar del Plata

Congreso; XLIV Congreso Argentino de Genética; 2015

Sociedad argentina de genética

En la principal zona de cultivo de trigo candeal las plantas están expuestas a temperaturas de congelamiento en la etapa reproductiva. Identificar nuevos genes y vías que participan en la respuesta a frío resulta de interés para el mejoramiento. El objetivo fue estudiar mediante RNA-Seq el transcriptoma de la línea CBW0101 (primaveral y tolerante a bajas temperaturas) en estadio reproductivo. Se analizaron plantas tratadas a 5° C durante 5 hs. Se secuenció por Illumina (3 réplicas/tratamiento), obteniéndose 124,7 Mi. de lecturas de calidad. Mediante ensamblado ?de novo? con Trinity se generaron 182.728 transcriptosde una longitud promedio de 733 pb, a partir de los cuales se realizó la anotación funcional con Trinotate. Se obtuvieron 797 diferenciales (EdgeR). De 508 transcriptos inducidos por frío, 350 fueron detectados solamente en las plantas tratadas. Por otra parte, 289 resultaron reprimidos por la baja temperatura, incluyendo 142 que sólo se expresaron en el control. Entre los genes inducidos por frío se encuentran los correspondientes a: Delta-1-pirrolina 5 carboxilatosintetasa, Omega-6-desaturasa de ácidos grasos, GDP-L-galactosa fosforilasa-2 y sacarosa- 1-fructosiltransferasa los cuales representan nuevos genes candidatos a estudiar en materiales de trigo candeal caracterizados fenotípicamente para este rasgo. El conjunto de genes que mostraron expresión diferencial refleja distintos mecanismos que se activan en una etapa previa a la exposición a temperaturas de congelamiento en el período de espigazón.