DETECCION DE VARIANTES ALELICAS DE MARCADORES FUNCIONALES MEDIANTE SSCP EN GIRASOL CULTIVADO

GARAYALDE A; FUSARI C; PANIEGO N; CARRERA A

Bahía Blanca

Jornada; II JORNADAS DE POSGRADO DEL DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA, BIOQUÍMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR; 2010

DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA, BIOQUÍMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR

Los marcadores funcionales derivan de sitios polimórficos presentes en los genes que afectan la variación fenotípica de un determinado carácter, resultando de utilidad en la selección de caracteres deseables para la mejora del cultivo, como la tolerancia a patógenos y estreses abióticos. La detección de variantes alélicas para estos marcadores es difícil cuando difieren en pocos o en un solo nucleótido, haciendo necesario la secuenciación del fragmento o la utilización sistemas de detección sensibles como la cromatografía líquida desnaturalizante de alto rendimiento (DHPLC) o el polimorfismo de conformación de cadena única (SSCP). El objetivo de este trabajo es la detección de variantes alélicas conocidas por secuenciación para el gen AALP (Arabidopsis Aleurain-like protease) en líneas de girasol cultivado mediante el sistema SSCP. Se analizaron 9 líneas cultivadas con el marcador funcional para el gen AALP mediante geles no desnaturalizantes de acrilamida y se registraron las bandas según su movilidad electroforética. Los 4 alelos reportados para este gen pudieron ser detectados mediante este sistema. Los SSCP resultan de utilidad para detectar variantes alélicas de marcadores funcionales disminuyendo los gastos relacionados a la secuenciación. Se continúa con la incorporación en el análisis de individuos silvestres del girasol y de nuevos marcadores funcionales.