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Tradicionalmente la identificación de ciliados de la familia Trichodinidae se realiza utilizando por un lado la morfometría, a través de la toma de medidas lineales del disco adhesivo y de los dentículos, y por otro lado describiendo detalladamente la forma de estos últimos. Sin embargo, la forma de los dentículos no puede ser analizada cuantitativamente mediante la morfometría tradicional. En los últimos años, las herramientas moleculares han resultado de gran ayuda a la hora de diferenciar especies de tricodinidos, pero su uso se ve muy limitado a los casos donde las infecciones son monoespecíficas. Por el contrario, la morfometría geométrica resulta una herramienta que proporciona información sobre los cambios en la forma, independientemente del tamaño del individuo, y además puede ser utilizada en casos de infecciones mixtas. En este estudio, se aplicó morfometría geométrica, a través de un análisis de Elíptico de Fourier a distintas especies de tricodinidos asociados a peces, con el fin de evaluar la eficacia de este método para detectar y cuantificar diferencias morfológicas. A partir de los outlines, se generaron coeficientes de Fourier que fueron luego utilizados para realizar un análisis de componentes principales (PCA) y a partir de este un análisis discriminante lineal (LDA). Los resultados obtenidos de los casos analizados, permiten establecer al análisis de Fourier como una herramienta útil para diferenciar especies y poblaciones dentro de este grupo de parásitos. De esta manera, el uso de la morfometría geométrica, especialmente el análisis elíptico de Fourier resulta un método cuantitativo óptimo para analizar las variaciones de la forma, pudiendo ser utilizado en otros grupos de parásitos.