Análisis comparativo de la microbiota bacteriana asociada al suelo de cultivos de tomate en invernáculo

VIO, SANTIAGO; GALAR, MARIA LINA; FERNANDEZ-LÓPEZ, MANUEL; GARCIA, SABRINA SOLEDAD; FERNANDEZ-GONZALES, ANTONIO JOSÉ; LUNA, MARIA FLAVIA; GARCIA, SABRINA SOLEDAD; BERNABEU, PAMELA; FERNANDEZ-GONZALES, ANTONIO JOSÉ; PISTORIO, MARIANO; LUNA, MARIA FLAVIA; VIO, SANTIAGO; BERNABEU, PAMELA; GALAR, MARIA LINA; PISTORIO, MARIANO; FERNANDEZ-LÓPEZ, MANUEL

Puerto Varas

Congreso; XXIX Reunión Latinoamericana de Rizobiología y 1er Simposio Internacional de Microbiología de Suelos y Ecología Microbiana; 2019

Universidad de la Frontera

Las plantas viven en estrecha asociación con microorganismos que habitan tanto en el exterior/interior de sus tejidos como en el espacio rizosférico,junto con los cuales han evolucionado en el contexto de complejas comunidades que poseen un rol fundamental en la salud y la productividad vegetal.Estas comunidades microbianas,pueden diferir según zonas de la planta, especie, estado fenológico, eventos de estrés, así como también según variables ambientales, características de los suelos y manejo de los cultivos, entre otros factores. El objetivo de este trabajo fue caracterizar las comunidades bacterianas asociadas al suelo rizosférico y no rizosférico, donde se desarrollan cultivos bajo cubierta de tomate variedad elpida de dos establecimientos del Cinturón Hortícola de La Plata (Argentina): Establecimiento I(E-1), un lote con 25 años ininterrumpidos de cultivo de tomate y Establecimiento II (E-2)con un lote nunca antes cultivado y su primer cultivo de tomate.Se tomaron muestras por triplicado del suelo rizosférico y no rizosférico de ambos establecimientos y se realizó la extracción de ADN con el kit de suelo FastDNA spin kit(MP Biomedicals). Se secuenció(PE300, Illumina MySeq) la región v3-v4 del gen 16S rRNA amplificada con los primers Pro341Fy Pro805R (Takahashi et al. 2014). Los resultados arrojaron un total de 2515 OTUs con una cobertura del 99,9%. Las muestras de suelo y rizosfera del E-2 mostraron índices de diversidad mayores que las respectivas muestras del E-1. La rizosfera mostró una mayor diversidad de las comunidades bacterianas que los bulk de suelo en ambos establecimientos. En cada establecimiento, las comunidades microbianas resultaron tener diferencias altamente significativas: si bien el número de OTUs compartidos entre los establecimientos es importante (85,6%), las diferencias halladas radicaron en la disparidad entre las abundancias de los OTUs en cada muestra.