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Los consorcios microbianos sintéticos (CMS) suelen ser de baja complejidad y hacen que los mecanismos de interacción y regulación sean fácilmente investigados. Con las secuencias genómicas se pueden identificar reacciones metabólicas específicas y posibles metabolitos intercambiados. Estos datos resultan útiles para desentrañar las interacciones metabólicas e investigar conceptos ecológicos claves. Este trabajo tuvo como objetivo estudiar las capacidades metabólicas de 6 cepas bacterianas (Sphingobium sp. (AM), Klebsiella aerogenes (B), Pseudomonas sp. (T y Bc-h), Inquilinus limosus (I) y Burkholderia sp. (Bk))aisladas de un consorcio naturaldegradador de hidrocarburos policíclicos aromáticos (PAH),empleando genómica funcional para proveer información en el diseño sistemático de un CMS. Se desarrolló un pipeline(fastp/Spades/prodigal/InterProScan/RASTserver/modelSeed)para el preprocesamiento, ensamblaje, predicción y anotación de las secuencias genómicas.El análisis in silico reveló que sólo una quinta parte de los genestotales codifican enzimas, transportadores y reguladores con funciones asignadas.Las cepas B y Bkmostraron una baja relación entre sí y con las otras cepas.Bpresentó un conjunto de enzimas únicasy no posee genes relacionados con las rutas de degradación de PAH;el agrupamiento por subsistemas reveló que Bk tiene mayor número de rutas metabólicas relacionadas a la degradación de PAH.AM es la cepa que menor número de enzimascomparte con el resto de las cepas aisladas del consorcio natural.Se predijeron las funciones metabólicas que desempeña cada miembro del consorcio y las interacciones dentro de la comunidad microbiana a escala genómica, proporcionando una base para la optimización del diseño de consorcios sintétic