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En el presente trabajo se planteó conocer la composición del ensamble de invertebrados acuáticos en sustratos leñosos sumergidos en ambientes lóticos del río Paraná y analizar si existen diferencias en los ensambles con el bentos y en relación con las variables físico-químicas y con la rugosidad de los sustratos leñosos entre el cauce principal y los cauces secundarios del río Paraná. Para ello se recolectaron 15 sustratos leñosos sumergidos del río Colastiné, Canal de Acceso y cauce principal del río Paraná. En el laboratorio se extrajeron e identificaron los invertebrados. Se determinó la densidad total, riqueza y diversidad, se calcularon correlaciones entre las variables ambientales y atributos de los ensambles de invertebrados, se realizó un NMDS y un análisis SIMPER. Se encontraron 56 taxa de invertebrados con una densidad promedio de 12287,9 ind/m2. Las taxa con mayor densidad fueron Limnoperna fortunei, Cricotopus sp. y Onconeura sp. La menor dominancia se encontró en el cauce principal y la mayor riqueza en los cauces secundarios. Las mayores diferencias en composición se dieron entre los cauces secundarios y el principal en relación con los taxones más abundantes (NMDS, SIMPER). Se determinaron correlaciones significativas positivas entre la riqueza y el pH, transparencia del agua y rugosidad de los leños y entre la densidad de invertebrados y la profundidad y transparencia y negativas entre la última y la conductividad. Se concluye que en los sustratos leñosos del sistema existe una composición diferente, mayor abundancia, densidad y riqueza de taxones de invertebrados en comparación con el bentos. Asimismo se concluye que los invertebrados utilizan los leños de diversas maneras durante diferentes momentos de sus ciclos vitales para la oviposición y emergencia, alimentación (xilofagia) y fijación. Trabajo financiado por PICT 2012 Nº 2791, FONCyT, ANPCyT, MinCyT.